133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2055 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  80.92 
 
 		 444 aa  711    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  97.54 
 
 		 452 aa  907    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  100 
 
 		 448 aa  925    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  97.54 
 
 		 452 aa  907    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  97.99 
 
 		 452 aa  910    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  99.33 
 
 		 448 aa  920    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  80.18 
 
 		 444 aa  711    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  62.27 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.09 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  40.19 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  40.14 
 
 		 421 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  37.78 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.8 
 
 		 421 aa  262  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.92 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.17 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  32.78 
 
 		 459 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  32.97 
 
 		 470 aa  222  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  35.63 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  32.49 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  52.79 
 
 		 222 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  31.33 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  34.44 
 
 		 435 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  38.41 
 
 		 684 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  31.35 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.02 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  30.79 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  30.82 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.15 
 
 		 483 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  32.24 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  32.61 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.52 
 
 		 412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.93 
 
 		 408 aa  177  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  51.67 
 
 		 441 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  28.1 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  55.65 
 
 		 247 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  56.25 
 
 		 183 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  46.27 
 
 		 203 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  47.73 
 
 		 196 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  49.64 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  48.51 
 
 		 178 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  44.37 
 
 		 212 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  50 
 
 		 200 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  44 
 
 		 169 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  44.52 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  34.65 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  53.12 
 
 		 177 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  49.24 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  45.38 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  33.76 
 
 		 196 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  48.84 
 
 		 87 aa  87  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  50.65 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  50.65 
 
 		 77 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  38.76 
 
 		 222 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.25 
 
 		 94 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.25 
 
 		 94 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.89 
 
 		 282 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  30.26 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.75 
 
 		 225 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  27.15 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.18 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.4 
 
 		 226 aa  51.2  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22 
 
 		 359 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  39.58 
 
 		 298 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  22.67 
 
 		 285 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  34.44 
 
 		 305 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.89 
 
 		 266 aa  50.1  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  36.59 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.21 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  36.23 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  38.71 
 
 		 284 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  24.34 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  35.63 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  42.11 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.66 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 		 601 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  32.26 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  25 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  24.42 
 
 		 271 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.39 
 
 		 258 aa  47.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.26 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.91 
 
 		 286 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.91 
 
 		 286 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 		 273 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  34.18 
 
 		 282 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 		 315 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  38.67 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  32 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  33.67 
 
 		 293 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.59 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  32.2 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.33 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.53 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  35.21 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  28.74 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.95 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>