More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1407 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  100 
 
 
297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  89.23 
 
 
297 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  70.95 
 
 
300 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  70.95 
 
 
300 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  69.26 
 
 
306 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  70.61 
 
 
298 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  61.54 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  56.04 
 
 
293 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  56.04 
 
 
293 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  59.53 
 
 
296 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  55.7 
 
 
293 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  58.19 
 
 
298 aa  329  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  54.52 
 
 
292 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  54.85 
 
 
296 aa  325  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  58.39 
 
 
293 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  57.38 
 
 
293 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  58.05 
 
 
294 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  59.93 
 
 
294 aa  321  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  61.87 
 
 
296 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  61.44 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  55.78 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  54.36 
 
 
293 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  53.02 
 
 
293 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  50.65 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  54.67 
 
 
303 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  52.22 
 
 
299 aa  288  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  55.17 
 
 
297 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  48.84 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  50 
 
 
319 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  51.33 
 
 
300 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  51.67 
 
 
301 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  52.58 
 
 
296 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  51.35 
 
 
292 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  45.6 
 
 
299 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  52.14 
 
 
326 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  50.35 
 
 
292 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  48.53 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  47.46 
 
 
296 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  44.85 
 
 
315 aa  235  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  49.15 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  45.75 
 
 
323 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  44.12 
 
 
310 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  40.7 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  45.73 
 
 
284 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  44.25 
 
 
305 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  46.15 
 
 
312 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  46.08 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  45.96 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  45.97 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  47.06 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  44.3 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  46.9 
 
 
309 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.94 
 
 
289 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.89 
 
 
279 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  46.55 
 
 
321 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.89 
 
 
279 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  44.48 
 
 
307 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.06 
 
 
281 aa  208  8e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  41.02 
 
 
295 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  37.02 
 
 
283 aa  206  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.63 
 
 
298 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.3 
 
 
298 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  42.39 
 
 
305 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  44.53 
 
 
329 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  43.9 
 
 
290 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.32 
 
 
272 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  42.65 
 
 
295 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  41.69 
 
 
304 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40.83 
 
 
289 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  42.27 
 
 
284 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  43.39 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  43.69 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  43.69 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  43.69 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  43.69 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  43.69 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  43.69 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  43.69 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  44.48 
 
 
306 aa  202  6e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  43.34 
 
 
295 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  43.21 
 
 
289 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.21 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  45.17 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.76 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  43 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  40.47 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.21 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.26 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.69 
 
 
295 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  43.69 
 
 
295 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  44.33 
 
 
294 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  44.33 
 
 
294 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  43.94 
 
 
283 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.86 
 
 
297 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  44.29 
 
 
290 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.86 
 
 
305 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.86 
 
 
297 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 
305 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.21 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.25 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>