More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3163 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  100 
 
 		 352 aa  716    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  32.55 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  33.03 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.96 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  31.22 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  29.67 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  29.67 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  29.67 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  29.67 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  31.28 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  30.33 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  31.28 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  31.75 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  30.09 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  29.95 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  44.25 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  30.81 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  30.37 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  25.23 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.06 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  43.9 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  35.33 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  34.71 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  37.17 
 
 		 294 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  37.17 
 
 		 294 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  32.84 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  43.59 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  41.3 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  28.63 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  28.63 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  43.48 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  31.86 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  47.83 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  32.82 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.86 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  37.76 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  37.93 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  35.78 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  31.51 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  35.11 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  30.36 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  35.2 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  29.15 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  38.68 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  36.56 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  26.6 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  28 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  40.74 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  44 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  36.04 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  30.82 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  43.96 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  47.89 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  38.53 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  39.56 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  35.16 
 
 		 529 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.66 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  43.42 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  30.53 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  30.82 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  25.11 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  32.2 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  28.33 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  39.6 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  28.49 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  34.78 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  30.14 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  37.21 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  26.17 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  36 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  41.03 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  41.03 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4223  parB-like partition proteins  44.93 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  28.63 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  39.51 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  38.6 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  43.42 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  38.32 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  36.79 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  37.04 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.04 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.04 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  37.61 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  39.02 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  35.9 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  35.9 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  32.82 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>