More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3049 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  70.07 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  52.52 
 
 		 281 aa  265  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  50.54 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  48.73 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  43.79 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  50.54 
 
 		 279 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  46.04 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  48.39 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.28 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  47.48 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  49.6 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  43.73 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  43.73 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  44.89 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  43.52 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  45.68 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  42.81 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  42.95 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  48.02 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  41.7 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  41.7 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  46.21 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  44.73 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  44.87 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.57 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  43.01 
 
 		 301 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.45 
 
 		 294 aa  204  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  42.37 
 
 		 302 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  45.32 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  45.94 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.67 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  46.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  43.01 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  44.6 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.9 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  41.38 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  42.21 
 
 		 295 aa  201  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.21 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.21 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.42 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  40.36 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  42.18 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  43.36 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  43.42 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  40.21 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  46.38 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  41.78 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  42.36 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  42.36 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.21 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.2 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  42.36 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.89 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  42.27 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  42.27 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  42.27 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  42.36 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  42.47 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  42.47 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  43.16 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  39.15 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 303 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  42.01 
 
 		 292 aa  194  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  39.73 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  41.92 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  42.4 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  42.81 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.51 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  41.78 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  41.49 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  41.34 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  41.36 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  49.08 
 
 		 367 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  42.43 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  43.88 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  44.18 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  43.06 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  41.58 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.93 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  40.54 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  41.96 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.61 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.85 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  42.18 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  41.22 
 
 		 294 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  41.7 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40.85 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  40.85 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.46 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  40.85 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>