More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4509 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  100 
 
 
298 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  99.66 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  97.32 
 
 
298 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  77.56 
 
 
298 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  47.93 
 
 
279 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  54.64 
 
 
306 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  47.93 
 
 
279 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  46.37 
 
 
282 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  45.89 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  44.03 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  49.16 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  46.34 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  48.16 
 
 
290 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  48.16 
 
 
290 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  46.88 
 
 
284 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  48.16 
 
 
290 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 
298 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  42.66 
 
 
281 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  46.99 
 
 
269 aa  225  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.52 
 
 
295 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  45.49 
 
 
292 aa  221  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.71 
 
 
294 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  46.33 
 
 
285 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  42.18 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  47.16 
 
 
289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  42.18 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  42.18 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  44.26 
 
 
295 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  44.93 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.38 
 
 
272 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  47.14 
 
 
291 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.25 
 
 
285 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  43.05 
 
 
296 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.63 
 
 
319 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  45.27 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  42.95 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  40.07 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  43.09 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  42.57 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.8 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  44.44 
 
 
294 aa  212  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  44.86 
 
 
274 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  39.02 
 
 
303 aa  210  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  46.84 
 
 
326 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  45.64 
 
 
306 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  44.83 
 
 
288 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  43.67 
 
 
293 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  45.64 
 
 
290 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  46.94 
 
 
282 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  46.28 
 
 
290 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  46.33 
 
 
296 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  45.95 
 
 
290 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  41.97 
 
 
323 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  41.22 
 
 
298 aa  208  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  45.56 
 
 
529 aa  208  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  44.33 
 
 
286 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.12 
 
 
306 aa  208  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.72 
 
 
289 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.62 
 
 
286 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  44.48 
 
 
294 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  45.27 
 
 
290 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.65 
 
 
289 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  40.69 
 
 
292 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  39.52 
 
 
295 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  43.88 
 
 
293 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  42.76 
 
 
296 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  40.27 
 
 
299 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  43.69 
 
 
297 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  42.47 
 
 
321 aa  205  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  40.54 
 
 
296 aa  205  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  43.54 
 
 
293 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  43.93 
 
 
297 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  45.27 
 
 
290 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  40.53 
 
 
293 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  42.96 
 
 
290 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  45.32 
 
 
392 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  43.96 
 
 
312 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.12 
 
 
284 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  43.6 
 
 
280 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  41.88 
 
 
333 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.22 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  41.3 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.07 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  40.2 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  42.52 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  44.37 
 
 
292 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  44.1 
 
 
288 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  42.47 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  40.8 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  39.38 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  41.78 
 
 
298 aa  199  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  41.67 
 
 
311 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  46.02 
 
 
292 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  41.31 
 
 
280 aa  198  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.42 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  41.37 
 
 
298 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  42.11 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  42.59 
 
 
335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  39.39 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.91 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>