More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2045 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  100 
 
 		 310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  62.59 
 
 		 304 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  57.32 
 
 		 305 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  54.52 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  44.89 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  46.5 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.24 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.91 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  45.21 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  42.63 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  46.28 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  46.76 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  40.52 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  44.04 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  40.66 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.26 
 
 		 285 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  44.05 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.95 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.75 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  38.8 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  43.55 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  42.67 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  35.64 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.4 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  43.61 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  40.19 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.32 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.58 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  44.09 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  37.85 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  43.41 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  44.88 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  43.41 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  43.46 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  40.19 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  40.26 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  41.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.59 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  44.87 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  42.72 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.94 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  40.2 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  39.4 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  41.72 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  40 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.39 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  41.64 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  44.52 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  41.4 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.94 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  41.07 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  38.46 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  39.27 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  39.27 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  41.31 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  41.31 
 
 		 295 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  41.27 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  41.31 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  41.31 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  39.47 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  40.95 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  40.95 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  41.94 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  42 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  41 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  38.94 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  38.94 
 
 		 283 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  40.69 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.61 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  39.87 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  38.28 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  39.8 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  38.28 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  35.97 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  42.01 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  37.34 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.94 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  39.09 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  37.62 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  39.3 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  39.03 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  39.03 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  39.1 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  36.23 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.7 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  41.3 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  45.36 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  36.18 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  36.18 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>