More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3320 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  46.23 
 
 
305 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  43.73 
 
 
286 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  44.26 
 
 
294 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  44.68 
 
 
289 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  42.86 
 
 
286 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  42.86 
 
 
286 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.39 
 
 
323 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  42.32 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  43.3 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.81 
 
 
285 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  40.89 
 
 
283 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  41.58 
 
 
283 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  41.24 
 
 
283 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  41.58 
 
 
283 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  41.3 
 
 
280 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  43.2 
 
 
278 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  40.89 
 
 
283 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.89 
 
 
283 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.89 
 
 
283 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  43.92 
 
 
286 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  38.7 
 
 
281 aa  229  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  40.55 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  41.14 
 
 
321 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  42.4 
 
 
283 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.18 
 
 
279 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  44.27 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.2 
 
 
295 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  45.2 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  42.42 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  43.05 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.89 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  43.77 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  45.2 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  37.99 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  40.33 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  44.03 
 
 
295 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  37.77 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  43.87 
 
 
256 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.84 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40.82 
 
 
291 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  38.63 
 
 
331 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  43.05 
 
 
294 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.08 
 
 
255 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  41.37 
 
 
307 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  44.56 
 
 
290 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  38.24 
 
 
330 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  38.24 
 
 
330 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  38.24 
 
 
330 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  38.07 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  41.78 
 
 
294 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  39.52 
 
 
290 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  42.86 
 
 
335 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  44.84 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  40.47 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  40.97 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.07 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  38.61 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  41.03 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.47 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  41.72 
 
 
280 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  40.07 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  40.07 
 
 
312 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  41.81 
 
 
299 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  40.71 
 
 
306 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  45.7 
 
 
290 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  41.02 
 
 
282 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.46 
 
 
288 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.46 
 
 
290 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  37.43 
 
 
341 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.68 
 
 
287 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  41.55 
 
 
283 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  41.55 
 
 
292 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  42.23 
 
 
292 aa  208  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  42.57 
 
 
272 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  44.14 
 
 
424 aa  208  9e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  44.27 
 
 
269 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.48 
 
 
294 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.4 
 
 
284 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  44.48 
 
 
293 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  41.38 
 
 
292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  41.38 
 
 
292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  41.38 
 
 
292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  38.46 
 
 
288 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  41.72 
 
 
292 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  41.38 
 
 
292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  39.23 
 
 
324 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  41.72 
 
 
292 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  41.72 
 
 
292 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  38.98 
 
 
286 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  39.16 
 
 
309 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  40.48 
 
 
294 aa  205  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.67 
 
 
304 aa  205  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  40.77 
 
 
331 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  40.07 
 
 
297 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  43.67 
 
 
298 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  42.66 
 
 
296 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  40.77 
 
 
307 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  43.99 
 
 
290 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  40.47 
 
 
301 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>