More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0501 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.41 
 
 
295 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  44.37 
 
 
286 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  45.79 
 
 
272 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.72 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  42.07 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  44.09 
 
 
282 aa  215  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  43.53 
 
 
282 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.27 
 
 
279 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  43.42 
 
 
284 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  44 
 
 
279 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40.97 
 
 
289 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.81 
 
 
279 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.93 
 
 
286 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.93 
 
 
286 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.88 
 
 
295 aa  208  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.32 
 
 
305 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  44.13 
 
 
285 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.47 
 
 
302 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  41.64 
 
 
285 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  42.18 
 
 
278 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  45.32 
 
 
272 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  41.67 
 
 
286 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  44.37 
 
 
288 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.3 
 
 
290 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.21 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  41.64 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.21 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  43.54 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  49.4 
 
 
367 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  40.28 
 
 
293 aa  199  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  41.69 
 
 
294 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  38.89 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  41.41 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.96 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.32 
 
 
290 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.19 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.32 
 
 
288 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  38.18 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.7 
 
 
269 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.86 
 
 
290 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  40.32 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.02 
 
 
323 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  40.21 
 
 
289 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  42.51 
 
 
290 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.21 
 
 
314 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  39.86 
 
 
304 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  39.52 
 
 
294 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  43.55 
 
 
286 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  38.73 
 
 
280 aa  191  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  40.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  42.51 
 
 
290 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  40.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  40.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40.28 
 
 
297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  40.28 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  40.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  40.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  40.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  40.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40.28 
 
 
297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  41.42 
 
 
311 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.28 
 
 
305 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  41.18 
 
 
298 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40.97 
 
 
291 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.55 
 
 
321 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.93 
 
 
305 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.57 
 
 
286 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  37.76 
 
 
298 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  39.4 
 
 
310 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36.82 
 
 
283 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.46 
 
 
283 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  36.46 
 
 
283 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  35.74 
 
 
283 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  35.74 
 
 
283 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  36.69 
 
 
283 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.46 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  37.74 
 
 
322 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  36.2 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  40.23 
 
 
329 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  38.11 
 
 
294 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  38.31 
 
 
297 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.4 
 
 
298 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  39.72 
 
 
283 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  36.46 
 
 
283 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  39.24 
 
 
290 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  44.64 
 
 
280 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0356  parB-like partition protein  42.62 
 
 
301 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.378212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  39.86 
 
 
294 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  39.57 
 
 
284 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  43.21 
 
 
290 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  39.93 
 
 
295 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  37.37 
 
 
285 aa  185  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  39.03 
 
 
311 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  42.51 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  38.57 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  40.93 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  38.24 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  38.51 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>