More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2145 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  100 
 
 
283 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  46.98 
 
 
321 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  56.02 
 
 
306 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  46.9 
 
 
286 aa  221  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.49 
 
 
294 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  42.05 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  43.96 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  45.73 
 
 
323 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.78 
 
 
286 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.68 
 
 
282 aa  205  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  45.59 
 
 
379 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  45.49 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  48.64 
 
 
358 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  42.95 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  43.68 
 
 
529 aa  195  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.86 
 
 
287 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  41.47 
 
 
314 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  42.81 
 
 
333 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  44.23 
 
 
377 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  45.31 
 
 
280 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  48.68 
 
 
319 aa  191  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  37.41 
 
 
285 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  44.72 
 
 
268 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.67 
 
 
283 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.01 
 
 
283 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  42.8 
 
 
367 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 
424 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 
283 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  44.7 
 
 
330 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  44.7 
 
 
330 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  44.7 
 
 
330 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  38.66 
 
 
283 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 
328 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  41.48 
 
 
335 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  38.1 
 
 
283 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  45.28 
 
 
286 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.73 
 
 
290 aa  188  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.23 
 
 
329 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  45.49 
 
 
331 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.63 
 
 
279 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.73 
 
 
288 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  40.51 
 
 
305 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  45.58 
 
 
293 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  43.92 
 
 
341 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.68 
 
 
284 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  39.72 
 
 
282 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  42.7 
 
 
274 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  50.75 
 
 
392 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  45.04 
 
 
334 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.63 
 
 
279 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  51.83 
 
 
309 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  39.84 
 
 
257 aa  185  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  36.6 
 
 
281 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.64 
 
 
283 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.92 
 
 
283 aa  185  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.73 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  41.49 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  37.64 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  46.41 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  40.94 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  35.25 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  35.25 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  46.19 
 
 
318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  36.79 
 
 
283 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  36.57 
 
 
289 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  42.98 
 
 
299 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  41.85 
 
 
410 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  49.1 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.64 
 
 
294 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  41.9 
 
 
450 aa  182  7e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  42.65 
 
 
344 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  45.74 
 
 
624 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.35 
 
 
290 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  40.23 
 
 
280 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.89 
 
 
290 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  47.42 
 
 
367 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.89 
 
 
290 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  42.98 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  43.19 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  37.04 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  42.65 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  46.67 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.51 
 
 
290 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.6 
 
 
272 aa  178  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  40.23 
 
 
347 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  42.55 
 
 
272 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  39.23 
 
 
283 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  45.92 
 
 
401 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  40.14 
 
 
472 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  34.28 
 
 
310 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.13 
 
 
314 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.04 
 
 
299 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  46.98 
 
 
304 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  39.64 
 
 
305 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.16 
 
 
289 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  37.1 
 
 
294 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  44.04 
 
 
305 aa  175  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  47.46 
 
 
306 aa  175  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  46.77 
 
 
438 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.49 
 
 
255 aa  175  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>