More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2030 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  100 
 
 		 306 aa  594  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  50.79 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  46.27 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  51.66 
 
 		 529 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  46.5 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  49.37 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.98 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  48.09 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  49.49 
 
 		 383 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  50.19 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  48.57 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  49.28 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  50.74 
 
 		 392 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  51.29 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  49.45 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  45.22 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  48.99 
 
 		 472 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  56.02 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  38.89 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  39.24 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  46.55 
 
 		 288 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  39.93 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  38.89 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.89 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.89 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  44.97 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  38.89 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  47.45 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  38.89 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  43.98 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.01 
 
 		 289 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  37.85 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  45.35 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  43.63 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.93 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  47.94 
 
 		 377 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  59.57 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.38 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  48.01 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  44.79 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  58.12 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.24 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  54.02 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  45.91 
 
 		 391 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  37.85 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  49.76 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  39.16 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  40.75 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  46.89 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  39.16 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.05 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.05 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  42.71 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  43.89 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  43.89 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.61 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38.46 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  48.94 
 
 		 398 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.64 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  41.7 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  49.02 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  43.56 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  50.71 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  46.18 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  41.67 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  43.96 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  42.67 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  48.42 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  45.28 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  41.81 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  48.71 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  47.43 
 
 		 438 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  43 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  46.38 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  38.78 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  47.47 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  42.96 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  43.04 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  47.06 
 
 		 394 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  43.81 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  44.26 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  40.27 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  55.15 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.95 
 
 		 290 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  40.98 
 
 		 422 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  38.96 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.87 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  39.35 
 
 		 282 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.97 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.97 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  43.09 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  40.74 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>