More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_14140 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  100 
 
 
401 aa  804    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  68.6 
 
 
282 aa  362  5.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  48.2 
 
 
422 aa  341  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  52.57 
 
 
286 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  46.21 
 
 
272 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  41.7 
 
 
306 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.73 
 
 
286 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  41.96 
 
 
274 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  40.32 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.25 
 
 
285 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  39.35 
 
 
305 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  41.06 
 
 
305 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.7 
 
 
289 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  38.55 
 
 
288 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  41.31 
 
 
279 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.54 
 
 
269 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  46.56 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.92 
 
 
286 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.92 
 
 
286 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.93 
 
 
295 aa  189  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  44.14 
 
 
297 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  40 
 
 
283 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.38 
 
 
282 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  38.85 
 
 
335 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  38.4 
 
 
321 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 
301 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.15 
 
 
294 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  50 
 
 
296 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.98 
 
 
284 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  44.78 
 
 
299 aa  186  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  42.15 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  42.59 
 
 
284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.69 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  42.4 
 
 
279 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  41 
 
 
285 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  37.89 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  38.49 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  41.38 
 
 
303 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  40 
 
 
281 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  48.21 
 
 
297 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  49.25 
 
 
292 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  41.11 
 
 
309 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  48.95 
 
 
300 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  42.08 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  37.83 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  40.38 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.4 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.35 
 
 
283 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  38.37 
 
 
282 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  36.68 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  43.26 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  38.17 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  39.16 
 
 
289 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  37.35 
 
 
283 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.35 
 
 
283 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.74 
 
 
283 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  32.68 
 
 
379 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.74 
 
 
283 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.35 
 
 
283 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.96 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2844  parB-like partition protein  41.6 
 
 
309 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  44.71 
 
 
299 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  37.35 
 
 
283 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  44.72 
 
 
297 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  45.32 
 
 
296 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  40.48 
 
 
298 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  41.48 
 
 
281 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  45.92 
 
 
283 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  39.38 
 
 
310 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  38.21 
 
 
256 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  39.92 
 
 
293 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  31.68 
 
 
392 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  39.92 
 
 
292 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  38.55 
 
 
295 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  38.21 
 
 
256 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  44.81 
 
 
298 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.63 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  41.37 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  40.16 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  36.86 
 
 
296 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  41.53 
 
 
298 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  47.09 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  41.94 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  41.53 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  40.31 
 
 
280 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  41.09 
 
 
283 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  47.06 
 
 
287 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  38.66 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  39.54 
 
 
312 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  41.54 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  36.68 
 
 
302 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  39.08 
 
 
286 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  45.95 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  39.86 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.26 
 
 
278 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.26 
 
 
278 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  37.59 
 
 
529 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  42.11 
 
 
290 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  40.24 
 
 
285 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>