More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4861 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  66.54 
 
 		 295 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  58.2 
 
 		 323 aa  345  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  67.82 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  58.1 
 
 		 333 aa  328  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  58.97 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  58.92 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  53.03 
 
 		 328 aa  318  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  56.88 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  56.54 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  53.72 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  53.37 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  57.04 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  53.19 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  53.19 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  53.19 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  56.76 
 
 		 529 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  48.64 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  56.15 
 
 		 472 aa  292  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  54.55 
 
 		 331 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  62.12 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  52.27 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  48.38 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  49.32 
 
 		 391 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  51.21 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  59.04 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  49.72 
 
 		 358 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  58.22 
 
 		 410 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  51.94 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  59.22 
 
 		 268 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  55.75 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  58.87 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  46.08 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  46.56 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  57.63 
 
 		 438 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  53.76 
 
 		 624 aa  245  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  49.82 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  55.94 
 
 		 394 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  45 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  39.74 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  39.54 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  40.65 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.76 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.76 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  38.76 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.94 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.94 
 
 		 283 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  41.44 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  38.44 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  39.12 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  38.44 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.31 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.31 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.62 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.14 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.76 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  40.65 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  40.97 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  41.81 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.76 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  41 
 
 		 256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.03 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.61 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  35.91 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38.03 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  40.61 
 
 		 256 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  37.29 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  37.42 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.75 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  37.66 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  38.02 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.17 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  39.7 
 
 		 278 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  39.7 
 
 		 278 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  38.54 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  39.94 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  40.38 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.76 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  39.34 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  38.36 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.85 
 
 		 281 aa  189  7e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  39.68 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  39.68 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  37.45 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  35.87 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  40.77 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  36.6 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.65 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.9 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  37.3 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.09 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  40.39 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  39.67 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  37.55 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  38.46 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  36.57 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  37.94 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>