More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1632 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  100 
 
 		 305 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  45.26 
 
 		 279 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  44.49 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  44.91 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.2 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  42.46 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.1 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.4 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  41.9 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  40.91 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  40.91 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  45.49 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  44.21 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  39.51 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.05 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.85 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  40.85 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  39.93 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  39.93 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  43.94 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  42.11 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  41.2 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  39.79 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  43.15 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.97 
 
 		 256 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  42.09 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  38.28 
 
 		 310 aa  211  7.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  42.97 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.79 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  43.04 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  43.86 
 
 		 274 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.8 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  44.06 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.4 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  41.32 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.68 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.28 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  40.2 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  44.08 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  39.34 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.38 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.27 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.98 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  39.06 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  37.24 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.52 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 285 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  42.14 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  39.52 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  37.63 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  40.68 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  41.03 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.39 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  41.81 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  41.34 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  40.34 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  42.52 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  40.34 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  41.44 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  40.65 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  38.72 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  39.45 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  38.64 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  39.65 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  40.07 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  39.38 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  40.83 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  39.39 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.64 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  37.84 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  40.83 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  40.86 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  39.59 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.4 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.4 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  36.62 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.4 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.4 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  40.2 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  36.62 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  41.92 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  36.62 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.02 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  42.71 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  40.97 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.4 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>