More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0388 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  100 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  95.61 
 
 		 296 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  89.53 
 
 		 296 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  84.12 
 
 		 293 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  82.09 
 
 		 294 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  80.74 
 
 		 293 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  77.52 
 
 		 298 aa  457  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  61.2 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  58.78 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  55.07 
 
 		 293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  54.18 
 
 		 293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  55.07 
 
 		 293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  56.8 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  55.44 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  53.77 
 
 		 288 aa  301  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  53.22 
 
 		 296 aa  295  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  50.33 
 
 		 303 aa  292  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  52.72 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  52.7 
 
 		 292 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  54.13 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  51.97 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  49.33 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  49.83 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  51.85 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  47.62 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  48.97 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  49.51 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  51.5 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  51.5 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  51.67 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  47.26 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  47.26 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  46.58 
 
 		 300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  46.31 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  45.57 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.36 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  45.14 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  42.27 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  45.76 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.98 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  48.64 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.75 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  44.18 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  43.09 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  43.09 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  45.17 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.4 
 
 		 279 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  42.3 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.1 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  42.96 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  36.77 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  44.36 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.94 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  43.3 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.09 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  42.76 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  42.76 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.81 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  41.24 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  42.29 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.61 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.05 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40.74 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  41.83 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  43.64 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.21 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  43.79 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  38.57 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  42.71 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.49 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  40.97 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.47 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  42.16 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  42.27 
 
 		 288 aa  193  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.86 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.77 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  39.2 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40.75 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  42.36 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  40.44 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.24 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  41.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  38.59 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.82 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  43.32 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  43.33 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  41.64 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  41.64 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>