More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0107 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 
294 aa  590  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  58.28 
 
 
293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  51.38 
 
 
289 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  50.35 
 
 
285 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  50.88 
 
 
283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  50.18 
 
 
283 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  50.35 
 
 
283 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  50 
 
 
283 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  49.65 
 
 
283 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  49.65 
 
 
283 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  49.82 
 
 
283 aa  278  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  49.65 
 
 
283 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  49.65 
 
 
283 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  46.51 
 
 
295 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  50.4 
 
 
256 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  48.03 
 
 
299 aa  256  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  47.25 
 
 
278 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  47.25 
 
 
278 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  50 
 
 
256 aa  254  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  47.58 
 
 
280 aa  243  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  43.86 
 
 
286 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.36 
 
 
282 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  42.76 
 
 
310 aa  226  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.15 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  42.47 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41.02 
 
 
298 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  38.3 
 
 
283 aa  214  9e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  42.37 
 
 
257 aa  215  9e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  41.72 
 
 
301 aa  214  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  40.13 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  40.8 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  43.77 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  40.46 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  44.53 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.86 
 
 
286 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.86 
 
 
286 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  43.01 
 
 
289 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  43.77 
 
 
333 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  41.02 
 
 
424 aa  209  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  43.73 
 
 
450 aa  209  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  39.13 
 
 
328 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  43.13 
 
 
261 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  41.18 
 
 
284 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  43.23 
 
 
472 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.2 
 
 
281 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  44.4 
 
 
330 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  44.4 
 
 
330 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  44.4 
 
 
330 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  43.75 
 
 
334 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.14 
 
 
290 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 
288 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  43.13 
 
 
295 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.66 
 
 
295 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  43.92 
 
 
268 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 
289 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.03 
 
 
305 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  43.89 
 
 
323 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.76 
 
 
290 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.4 
 
 
306 aa  202  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  41.35 
 
 
335 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  39.65 
 
 
294 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  46.88 
 
 
287 aa  201  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  37.58 
 
 
304 aa  201  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.56 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.56 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  38.91 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  38.77 
 
 
529 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  40.99 
 
 
272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  39.36 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  40.77 
 
 
309 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  38.97 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  41.33 
 
 
379 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  39.25 
 
 
292 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  43.45 
 
 
290 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  38.26 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  43.6 
 
 
290 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  41.05 
 
 
279 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  36.53 
 
 
331 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  39.66 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  41.76 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  42.8 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  41.28 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.77 
 
 
255 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  39.16 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  42.91 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.25 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  40 
 
 
290 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  37.17 
 
 
305 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  40.41 
 
 
292 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  40.75 
 
 
280 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  37.63 
 
 
284 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.24 
 
 
295 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  39.38 
 
 
289 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  38.62 
 
 
289 aa  193  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  39.47 
 
 
314 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  40.27 
 
 
292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  40.27 
 
 
292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  40.27 
 
 
292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  39.1 
 
 
286 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  40.27 
 
 
292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>