More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0068 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  100 
 
 		 311 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  86.04 
 
 		 311 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  79.03 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  79.55 
 
 		 303 aa  474  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  78.14 
 
 		 313 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  75.96 
 
 		 311 aa  464  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  74.37 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  74.02 
 
 		 331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  73.72 
 
 		 331 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  64.82 
 
 		 302 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  63.55 
 
 		 303 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  63.87 
 
 		 303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  61.49 
 
 		 303 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  64.63 
 
 		 303 aa  345  7e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  60.53 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  60.53 
 
 		 305 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  60.26 
 
 		 295 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  60.53 
 
 		 297 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  60.53 
 
 		 297 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  60.26 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  60.53 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  60.53 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  60.53 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  60.53 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  60.53 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  60.53 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  60.53 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  60.2 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  59.28 
 
 		 295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  60.53 
 
 		 297 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  60.53 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  59.87 
 
 		 297 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  55.26 
 
 		 286 aa  305  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  60.52 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  55.81 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  60.84 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  53.67 
 
 		 284 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  53.16 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  49.2 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  52.48 
 
 		 284 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  50.66 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  48.51 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  46.69 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  48.38 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  47.37 
 
 		 294 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  49.02 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  49.02 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  49.22 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  47.88 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  49.35 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  48.08 
 
 		 292 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  48.53 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  46.13 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  46.2 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  47.06 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  47.74 
 
 		 290 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  46.23 
 
 		 289 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  51.49 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  47.42 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  44.34 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  45.69 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  46.75 
 
 		 290 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  45.31 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  48.04 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  44.52 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  44.3 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  48.21 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  47.04 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  44.52 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  44.52 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  47.56 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  45.28 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  44.52 
 
 		 292 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  43.69 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  43.69 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  43.69 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  43.69 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  46.43 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  45.63 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  46.82 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  47.71 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  47.89 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  47.15 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  45.71 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.04 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  46.84 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  44.13 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  43.65 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  45.4 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  45.66 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  46.84 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.74 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  50 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  42.39 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  43.04 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  46.47 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  41.95 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  44.36 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  44.63 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>