More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4515 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  95.89 
 
 		 292 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  95.19 
 
 		 292 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  95.19 
 
 		 292 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  94.85 
 
 		 292 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  93.81 
 
 		 292 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  84.88 
 
 		 292 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  80.55 
 
 		 294 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  76.27 
 
 		 296 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  77.05 
 
 		 292 aa  454  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  77.55 
 
 		 294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  77.21 
 
 		 294 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  80.14 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  63.57 
 
 		 290 aa  362  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  63.09 
 
 		 300 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  63.7 
 
 		 292 aa  347  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  59.93 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  59.59 
 
 		 290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  59.59 
 
 		 290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  59.59 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  58.22 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  61.64 
 
 		 290 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  61.64 
 
 		 290 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  57.68 
 
 		 291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  59.25 
 
 		 290 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  55.48 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  61.9 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  58.56 
 
 		 290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  54.67 
 
 		 304 aa  311  9e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  58.9 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  54.98 
 
 		 293 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  55.02 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  53.31 
 
 		 283 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  54.3 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  54.33 
 
 		 290 aa  301  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  54.33 
 
 		 288 aa  301  9e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  52.7 
 
 		 295 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  52.9 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  51.88 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  53.06 
 
 		 286 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  52.04 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  50.5 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  50.5 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  50.33 
 
 		 303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  53.85 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  51.5 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  48.8 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  48.79 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  49.32 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  49.32 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  49.32 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  52.22 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  50.51 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  49.32 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  48.98 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  49.66 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  48.97 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  48.63 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  48.97 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  48.97 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  48.97 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  48.97 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  48.97 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  48.97 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  48.97 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  48.63 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  47.6 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  50.66 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  51.04 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  49.66 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  49.32 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  49.32 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  51.35 
 
 		 300 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  48.01 
 
 		 309 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  50.67 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  49.33 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  45.05 
 
 		 315 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  48.84 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  47.02 
 
 		 302 aa  238  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  44.48 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  45.36 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  45.73 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  45.08 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  45.48 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  44.44 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  43.2 
 
 		 331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  50.38 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  46.43 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  48.31 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  47.15 
 
 		 375 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  47.6 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  42.9 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  43.69 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  44.95 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  44.84 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  45.36 
 
 		 296 aa  231  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  44.13 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>