More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0008 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  100 
 
 		 281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  57.72 
 
 		 289 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  51.07 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  49.48 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  49.48 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  46.53 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  47.89 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  47.27 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  46.45 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  48.74 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  47.16 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  44.13 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.97 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  46.1 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  46.45 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  43.51 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  41.79 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  45.16 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  45.16 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  44.8 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  44.8 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  44.8 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  46.45 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  45.07 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  42.45 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  43.39 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  39.51 
 
 		 305 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  42.66 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  43.57 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.5 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38.7 
 
 		 302 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 294 aa  222  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  44.49 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  41.46 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  43.54 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  44.22 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  46.75 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  46.61 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  42.07 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  37.85 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  46.61 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  41.92 
 
 		 304 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  47.54 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.37 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  42.52 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  42.31 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.05 
 
 		 284 aa  211  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.37 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  38.74 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.9 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.9 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  42.81 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  40.61 
 
 		 326 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.8 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  40.64 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  41.73 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  44.22 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  37.24 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  43.06 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  43.31 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  36.77 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  43.31 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  43.99 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  38.89 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  41.2 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  37.7 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  41.98 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  40.07 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  40.7 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  42.51 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  41.3 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.05 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.05 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  40.28 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  41.46 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  42.07 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  41.26 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  41.46 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  41.46 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  40.56 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  41.08 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  40.89 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  39.79 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  36 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  38.64 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  40.69 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.07 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  41.11 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  40.57 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  38.64 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.68 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>