More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3552 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  84.08 
 
 
285 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  63.03 
 
 
283 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  62.68 
 
 
283 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  62.68 
 
 
283 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  62.32 
 
 
283 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  62.68 
 
 
283 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  62.46 
 
 
283 aa  354  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  62.81 
 
 
283 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  62.68 
 
 
283 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  61.4 
 
 
283 aa  349  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  64.68 
 
 
256 aa  328  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  64.29 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  51.38 
 
 
294 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  51.58 
 
 
282 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  47.92 
 
 
293 aa  266  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  46.33 
 
 
295 aa  256  4e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  45.39 
 
 
286 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  46.21 
 
 
278 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  46.21 
 
 
278 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  45.97 
 
 
299 aa  248  9e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  45.49 
 
 
280 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  42.46 
 
 
305 aa  234  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  43.51 
 
 
281 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  40.97 
 
 
286 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  40.97 
 
 
286 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  42.41 
 
 
302 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.94 
 
 
294 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  44 
 
 
289 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  41.61 
 
 
283 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.95 
 
 
295 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  42.75 
 
 
335 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 
279 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  43.8 
 
 
333 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  42.8 
 
 
367 aa  216  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.8 
 
 
314 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  43.55 
 
 
288 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39.02 
 
 
283 aa  215  7e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  41.43 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  44.66 
 
 
450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  41.75 
 
 
298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  40.67 
 
 
303 aa  212  7e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39.31 
 
 
321 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  42.05 
 
 
284 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  41.92 
 
 
301 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  40.36 
 
 
331 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  41.92 
 
 
296 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  39.86 
 
 
334 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  40.97 
 
 
282 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.22 
 
 
299 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  42.05 
 
 
278 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  37.38 
 
 
328 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  43.08 
 
 
268 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  39.38 
 
 
306 aa  209  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  41.67 
 
 
298 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.2 
 
 
279 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  40.85 
 
 
279 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  40.85 
 
 
280 aa  208  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  41.32 
 
 
298 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  41.86 
 
 
379 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  42.76 
 
 
284 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  41.46 
 
 
281 aa  208  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  41.44 
 
 
330 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  41.38 
 
 
303 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  41.44 
 
 
330 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  41.44 
 
 
330 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  43.46 
 
 
358 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40.33 
 
 
305 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  39.65 
 
 
296 aa  205  6e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  43.01 
 
 
306 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.43 
 
 
269 aa  205  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  41.8 
 
 
309 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  41.15 
 
 
529 aa  204  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  42.37 
 
 
295 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  41.95 
 
 
391 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  40.56 
 
 
288 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  43.51 
 
 
410 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  39.79 
 
 
297 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  38.68 
 
 
293 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 
424 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.32 
 
 
306 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  38.68 
 
 
293 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.21 
 
 
282 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  40.91 
 
 
472 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  42.5 
 
 
272 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  42.14 
 
 
286 aa  202  5e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.22 
 
 
323 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  38.36 
 
 
341 aa  201  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  40.27 
 
 
312 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  42.36 
 
 
294 aa  202  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.85 
 
 
287 aa  201  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  41.55 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  38.1 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  40 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  40.89 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  39.46 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.81 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  40.89 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  40.83 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.81 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>