More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1277 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  55.78 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  53.31 
 
 		 299 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  51.68 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  53.29 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  53.72 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  56.25 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  54.48 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  57.29 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  56.45 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  56.45 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  55.14 
 
 		 294 aa  288  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  54.18 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  53.12 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  55.14 
 
 		 297 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  51.68 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  52.36 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  52.13 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  53.79 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  51.04 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  53.42 
 
 		 297 aa  279  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  51.97 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  51.84 
 
 		 294 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  51.72 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  51.72 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  51.21 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  52.01 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  52.51 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  51.34 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  49.34 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  49.49 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  46.58 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  46.51 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  49.83 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  45.58 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  49.83 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  47.97 
 
 		 298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  49.17 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  45.78 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  49.14 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  44.41 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  40.49 
 
 		 290 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  40.49 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  40.49 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.81 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  41.9 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.07 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  41.55 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  42.25 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  40.49 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  43.21 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  41.61 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.73 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  40.34 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  40.34 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  40.69 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.38 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  44.72 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  40.27 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40 
 
 		 274 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  40 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  40 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  40 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  40 
 
 		 292 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  40 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  41.2 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  41.82 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  39.73 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  43.27 
 
 		 289 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  46.06 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  41.94 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  39.08 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  39.19 
 
 		 292 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  37.72 
 
 		 295 aa  201  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  40.21 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  39.08 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.82 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.32 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  39.45 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  39.45 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  42.17 
 
 		 256 aa  200  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  40.64 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  40.21 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  42.41 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.47 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  39 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  41.58 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  43.5 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  38.93 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  38.61 
 
 		 263 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  43.6 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  40.26 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.68 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  39.4 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>