More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0133 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  100 
 
 
294 aa  593  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.32 
 
 
295 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  43.4 
 
 
286 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  43.94 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  40.55 
 
 
282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  43.6 
 
 
285 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.66 
 
 
286 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.66 
 
 
286 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  42.37 
 
 
302 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.14 
 
 
289 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  42.16 
 
 
284 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.32 
 
 
290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  42.53 
 
 
283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  44.91 
 
 
274 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  42.53 
 
 
283 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  42.36 
 
 
289 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.91 
 
 
283 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  44.58 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  42.53 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  42.53 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  42.53 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  39.38 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  39.38 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40.54 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  40.85 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.4 
 
 
323 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  40.85 
 
 
279 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.48 
 
 
294 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.53 
 
 
283 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  41.76 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  41.78 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  44.18 
 
 
256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  41.87 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  44.64 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.66 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  40.28 
 
 
290 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  42.81 
 
 
284 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  40.28 
 
 
290 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  38.06 
 
 
298 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.65 
 
 
279 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.3 
 
 
279 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  40.28 
 
 
290 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  41.73 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  40.55 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  39.56 
 
 
329 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.13 
 
 
295 aa  195  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  38.36 
 
 
307 aa  195  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  39.35 
 
 
304 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  40.94 
 
 
298 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  42.86 
 
 
315 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  43.33 
 
 
289 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  40.97 
 
 
292 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  39.93 
 
 
335 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  39.87 
 
 
305 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  40.67 
 
 
334 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  38.01 
 
 
286 aa  192  7e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.62 
 
 
283 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  42.92 
 
 
281 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.21 
 
 
286 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  40.67 
 
 
331 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  40.41 
 
 
299 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  39.51 
 
 
278 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  40.46 
 
 
328 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  39.79 
 
 
290 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  38.46 
 
 
283 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  39.93 
 
 
293 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  40.6 
 
 
529 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  41.01 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.98 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  40.74 
 
 
330 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  40.74 
 
 
330 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  38.62 
 
 
292 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  38.62 
 
 
292 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  38.62 
 
 
292 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  40.74 
 
 
330 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  38.62 
 
 
292 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  37.63 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  44.8 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  37.88 
 
 
292 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  38.75 
 
 
286 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  37.84 
 
 
294 aa  188  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  38.02 
 
 
280 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  36.4 
 
 
283 aa  187  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  37.97 
 
 
307 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 
424 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.98 
 
 
314 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  38.94 
 
 
306 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  38.91 
 
 
288 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.8 
 
 
306 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.91 
 
 
269 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  40.53 
 
 
295 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  38.89 
 
 
294 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  37.2 
 
 
296 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  38.95 
 
 
379 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  38.43 
 
 
280 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  38.28 
 
 
292 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  39.38 
 
 
294 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  37.18 
 
 
310 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.07 
 
 
303 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  38.26 
 
 
312 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>