More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0040 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  42.18 
 
 
298 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  41.84 
 
 
298 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  41.84 
 
 
298 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  44.07 
 
 
295 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  43.34 
 
 
289 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.24 
 
 
286 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.03 
 
 
284 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.12 
 
 
295 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  41.92 
 
 
291 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.44 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  41.02 
 
 
294 aa  219  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.18 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.81 
 
 
323 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  41.06 
 
 
304 aa  218  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  44.61 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  44.11 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  42.12 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.8 
 
 
281 aa  216  4e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.75 
 
 
295 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.05 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  42.19 
 
 
321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  37.25 
 
 
306 aa  215  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.5 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  42.03 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  41.3 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  41.33 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.1 
 
 
290 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.1 
 
 
290 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  40.3 
 
 
334 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  41.92 
 
 
292 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  40.88 
 
 
296 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  41.92 
 
 
292 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  41.92 
 
 
292 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  41.92 
 
 
292 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  41.92 
 
 
292 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  39.26 
 
 
299 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  44.36 
 
 
309 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  42.81 
 
 
297 aa  208  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  40.06 
 
 
331 aa  208  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  41.23 
 
 
303 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  41.44 
 
 
292 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  42 
 
 
319 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  41.84 
 
 
298 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  41.69 
 
 
280 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  44.52 
 
 
290 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.49 
 
 
272 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  42.19 
 
 
303 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  40.79 
 
 
307 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  44.33 
 
 
290 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  42.11 
 
 
309 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  40.46 
 
 
318 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  40.56 
 
 
286 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  41.58 
 
 
292 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  41.75 
 
 
310 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  41.58 
 
 
292 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  37.95 
 
 
302 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40 
 
 
284 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  39.58 
 
 
300 aa  205  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  41.69 
 
 
298 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  41.32 
 
 
283 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  38.77 
 
 
330 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  41.5 
 
 
301 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  38.77 
 
 
330 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  38.77 
 
 
330 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  43.34 
 
 
287 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  37.11 
 
 
283 aa  204  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.98 
 
 
283 aa  204  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.89 
 
 
305 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  42.07 
 
 
292 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  37.85 
 
 
286 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  37.85 
 
 
286 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  41.69 
 
 
292 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.89 
 
 
305 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  41.24 
 
 
292 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  40.89 
 
 
292 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  40.89 
 
 
295 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40.89 
 
 
297 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40.89 
 
 
297 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  41.24 
 
 
292 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  41.12 
 
 
303 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  43.54 
 
 
294 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  37.46 
 
 
333 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.41 
 
 
294 aa  202  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  37.62 
 
 
303 aa  202  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  40.54 
 
 
290 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  36.9 
 
 
293 aa  202  7e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  39.8 
 
 
294 aa  202  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  43.4 
 
 
306 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  38.64 
 
 
314 aa  202  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  40.29 
 
 
305 aa  201  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  40.21 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  40.55 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  40.55 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  40.55 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  40.38 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  40.58 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  40.21 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  40.14 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  40.55 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>