More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3934 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  52.22 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  52.22 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  50.51 
 
 		 286 aa  275  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  45.73 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  46.53 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  46.31 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  47.39 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  44.22 
 
 		 282 aa  242  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  43.52 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  46.07 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  43.34 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  43.6 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  43.34 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  44.93 
 
 		 279 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.32 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.71 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  42.37 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.86 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  43.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  44.93 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  43.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  43.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  43.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  43.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  43.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.86 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  43.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  45.17 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  44.56 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  45.05 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  43.1 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  42.56 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  43.79 
 
 		 272 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  40.42 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  41.32 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  40.77 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.77 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  53.81 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  42.41 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  40.42 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.42 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  43.2 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  42.32 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  44.22 
 
 		 292 aa  224  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  42.16 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  40.42 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.26 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  40.61 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  41.18 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.62 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.95 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  45.49 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  40.47 
 
 		 306 aa  221  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  43.54 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.54 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  42.63 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  39.52 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  39.52 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  40.98 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  39.93 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  40.34 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.3 
 
 		 290 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.3 
 
 		 290 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  42.86 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.23 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  42 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  41.89 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  41.89 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  43.85 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  39.52 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  41.2 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  40.14 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  42.76 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  40.69 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  40.82 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  41.28 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  41.37 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.61 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  44.56 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  39.06 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  43.49 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  43.88 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  43.88 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  43.88 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  43.88 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  42.36 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  40.72 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  46.22 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  42.57 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  44.07 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  44.07 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>