More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2606 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  100 
 
 		 285 aa  564  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  46.81 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  46.45 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  47.37 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  46 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  45.97 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  45.97 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  43.45 
 
 		 289 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.69 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.18 
 
 		 290 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  43.21 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  44.98 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  44.64 
 
 		 290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  44.64 
 
 		 290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  42.91 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  41.22 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  43.06 
 
 		 290 aa  211  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  45.3 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  43.06 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  40.2 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  41.75 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  43.55 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  42.03 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  42.03 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  42.03 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  42.03 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.73 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  44.13 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  42.03 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  41.36 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  40.94 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  45.64 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  40.61 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  40.94 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  40.96 
 
 		 292 aa  204  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 292 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  42.81 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.53 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  40.97 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.09 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.94 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  37.63 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  44.18 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  42.72 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.33 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  44.71 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  43.58 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  41.3 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  43.77 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  39.59 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  42.66 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  44.13 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.54 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  43.58 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.28 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  39.31 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  40.89 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  42.23 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40.98 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  42.05 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.3 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  44.86 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  41.24 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  43.9 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  43.9 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  40.55 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  43.9 
 
 		 297 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  43.9 
 
 		 297 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.1 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39.66 
 
 		 321 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  43.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  43.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  43.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  43.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  43.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  43.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  43.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  39.44 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  40.14 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  37.97 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  41.87 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  42.96 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  41.7 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  41.75 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  44.71 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  40.07 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  42.34 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  42.61 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  39.8 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  41.94 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40.69 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  37.62 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  41.11 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.36 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.3 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  42.86 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>