More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1218 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1218  ParB family protein  100 
 
 
283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  56.43 
 
 
281 aa  310  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  56.27 
 
 
283 aa  300  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  45.53 
 
 
326 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  43.42 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  42.29 
 
 
294 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  44.1 
 
 
293 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  40.93 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  44.33 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  44.41 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  44.33 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  41.44 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.02 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  42.46 
 
 
301 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  42.46 
 
 
296 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  43.16 
 
 
296 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  47.62 
 
 
256 aa  232  6e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  41.47 
 
 
296 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  43.55 
 
 
286 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 
288 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  42.46 
 
 
300 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  43.99 
 
 
293 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  42.27 
 
 
296 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  37.16 
 
 
319 aa  228  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  42.07 
 
 
292 aa  228  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  41.01 
 
 
284 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  42.86 
 
 
293 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  41.84 
 
 
293 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  42.71 
 
 
298 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  45.32 
 
 
289 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  42.66 
 
 
299 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  41.4 
 
 
296 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  42.81 
 
 
294 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  42.11 
 
 
293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  43.2 
 
 
295 aa  225  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  40.58 
 
 
280 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  43.88 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  41.24 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  44.49 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  40 
 
 
297 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  39.5 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  44.88 
 
 
286 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  44.88 
 
 
286 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  37.89 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.72 
 
 
290 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  40.07 
 
 
290 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  40.07 
 
 
290 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  42.63 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  40.93 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  40.99 
 
 
303 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  39.32 
 
 
304 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  42.16 
 
 
290 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  42.16 
 
 
288 aa  215  7e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.02 
 
 
289 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  38.51 
 
 
309 aa  215  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  38.3 
 
 
294 aa  214  9e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  41.44 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  41.76 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.64 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  39.06 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.24 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  40.26 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  41.75 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  41.13 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  38.85 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  42.16 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  41.4 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  39.53 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  41.32 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  39.93 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.58 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  40.29 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  41.13 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  41.4 
 
 
292 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  41.4 
 
 
292 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  41.4 
 
 
292 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  41.4 
 
 
292 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  40.99 
 
 
290 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39.19 
 
 
321 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.45 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.45 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.45 
 
 
305 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  42.16 
 
 
292 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  40.43 
 
 
290 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40.88 
 
 
274 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  39.92 
 
 
529 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40 
 
 
291 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.45 
 
 
305 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  40.7 
 
 
292 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.8 
 
 
295 aa  209  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.85 
 
 
283 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  41.01 
 
 
295 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  38.38 
 
 
289 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  41.4 
 
 
292 aa  208  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.45 
 
 
279 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  40.7 
 
 
292 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  40.7 
 
 
292 aa  208  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.86 
 
 
283 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  40.29 
 
 
295 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.79 
 
 
284 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>