More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0107 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  82.16 
 
 		 279 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  71.91 
 
 		 278 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  69.66 
 
 		 279 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  69.66 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  59.63 
 
 		 282 aa  321  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  59.19 
 
 		 284 aa  311  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  53.36 
 
 		 284 aa  275  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  45.82 
 
 		 305 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  47.66 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  47.66 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  47.66 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  41.61 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  47.86 
 
 		 298 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  47.72 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  49.6 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  44 
 
 		 286 aa  214  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  44 
 
 		 286 aa  214  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  48.18 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  48.18 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  45.24 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  43.23 
 
 		 288 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.28 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  44.57 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  44.22 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  44.23 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  41.82 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.32 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  45.24 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  41.92 
 
 		 299 aa  205  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  43.43 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  45.24 
 
 		 422 aa  203  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  44.71 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  44.27 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  46.06 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  46.06 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  45.31 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  43.27 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  46.4 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  45.91 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  42.54 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  45.28 
 
 		 290 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  52.79 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  42.97 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  45.28 
 
 		 290 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  45.67 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  43.41 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  44.66 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  45.42 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  43.41 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  45.45 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  42.74 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  50 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  54.01 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  45.28 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  43.03 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  43.7 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  43.03 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  42.08 
 
 		 292 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  43.2 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  43.03 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  43.03 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  44.49 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  48.79 
 
 		 292 aa  194  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  43.02 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  43.03 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  45.04 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  43.43 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  43.03 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.49 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  46.15 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  46.06 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  44.27 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  44.27 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  39.22 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  41.39 
 
 		 391 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  42.63 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  42.63 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.63 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  44.94 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  40.39 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  44.92 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.63 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  52.63 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  40.38 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  49.39 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  43.97 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  41.54 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  44.27 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  43.48 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  42.63 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  43.92 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  40.21 
 
 		 392 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  46.72 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  40.81 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>