More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5027 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  56.71 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  55.71 
 
 		 293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  53.79 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  53.79 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  52.04 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  53.9 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  52.41 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  53.77 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  53.77 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  51.01 
 
 		 301 aa  288  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  56.44 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  54.03 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  51.7 
 
 		 296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  51.38 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  53.42 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  55.05 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  50.68 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  53.82 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  49.83 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  49.17 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  49.32 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  49.66 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  49.15 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  49.32 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  50.34 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  50 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  52.31 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  52.13 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  52.82 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  43.09 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  51.53 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  47.21 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  50.34 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  48.46 
 
 		 306 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  47 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  50 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  48.45 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  51.89 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  43.88 
 
 		 292 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  43.21 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.69 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  43.65 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  45.08 
 
 		 290 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  44.67 
 
 		 290 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  36.21 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  45.39 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  42.76 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  43.67 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  40.2 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  36.95 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  46 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  47.44 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.84 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  44.07 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  44.07 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.37 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.58 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.62 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  43.75 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  41.32 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  35.99 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  42.62 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.82 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  44.48 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.07 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  43.2 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.19 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.73 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  42.86 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  41.52 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  43.14 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  42.37 
 
 		 284 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  39.8 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  41.3 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  42.72 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.02 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  40.53 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  42.72 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  39.93 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40.75 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  40.88 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  40.59 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.05 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.41 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  42.76 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  42.76 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  42.76 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  42.76 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  42.76 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.41 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  42.76 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  42.76 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  42.28 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  40.61 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>