More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1565 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  65.15 
 
 
303 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  64.17 
 
 
302 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  48.24 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  48.54 
 
 
306 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  49.08 
 
 
304 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  47.9 
 
 
311 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  47.57 
 
 
305 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  43.75 
 
 
296 aa  241  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  43.56 
 
 
289 aa  239  5.999999999999999e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  44.26 
 
 
298 aa  228  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  42.76 
 
 
294 aa  226  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  43.52 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  42.16 
 
 
317 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  41.39 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  41.39 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  42.86 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  38.28 
 
 
305 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  37.83 
 
 
286 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  42.52 
 
 
294 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  36.93 
 
 
323 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.12 
 
 
282 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  41.57 
 
 
295 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  40.79 
 
 
367 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  41.72 
 
 
295 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  41.42 
 
 
422 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.75 
 
 
283 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.42 
 
 
283 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.59 
 
 
285 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  38.16 
 
 
299 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  41.86 
 
 
296 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.75 
 
 
283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  38 
 
 
283 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  39.73 
 
 
312 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  40.4 
 
 
295 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.87 
 
 
283 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  38.75 
 
 
529 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  37.2 
 
 
344 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  37.39 
 
 
330 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  37.39 
 
 
330 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  37.39 
 
 
330 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.75 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.42 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  38.82 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  36.36 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.42 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  40.68 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  39.38 
 
 
256 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  38.78 
 
 
341 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  37.34 
 
 
295 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  40.08 
 
 
268 aa  199  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  38.44 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  41.5 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.87 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  40.65 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  39 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  35.67 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  38.46 
 
 
257 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  38.54 
 
 
279 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  36.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  36.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  36.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  36.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  36.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  36.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  36.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  36.12 
 
 
334 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  33.65 
 
 
318 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  38.35 
 
 
450 aa  195  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  36.48 
 
 
295 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  38.4 
 
 
333 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  33.75 
 
 
328 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  40.15 
 
 
379 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  38.08 
 
 
282 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  39.85 
 
 
392 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  36.73 
 
 
305 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.38 
 
 
255 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  38.08 
 
 
284 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  37.07 
 
 
294 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  37.88 
 
 
298 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  37.79 
 
 
272 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  39.38 
 
 
329 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  36.58 
 
 
283 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  43.86 
 
 
287 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  34.87 
 
 
294 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  37.12 
 
 
321 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.39 
 
 
304 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  38.51 
 
 
298 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  35.31 
 
 
298 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  39 
 
 
309 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  37.34 
 
 
319 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  36.84 
 
 
293 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  35.74 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  35.74 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  36.52 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  38.79 
 
 
282 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  38.18 
 
 
298 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  41.26 
 
 
312 aa  189  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  40.47 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  38.3 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>