More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3719 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  100 
 
 		 383 aa  744    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  68 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  63.01 
 
 		 379 aa  438  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  56.99 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  66.38 
 
 		 529 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  60.05 
 
 		 410 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  58.31 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  55.47 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  54.25 
 
 		 438 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  66.29 
 
 		 321 aa  349  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  65.49 
 
 		 318 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  63.99 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  63.67 
 
 		 329 aa  342  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  53.45 
 
 		 391 aa  339  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  65.06 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  51.99 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  60.47 
 
 		 323 aa  336  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  67.59 
 
 		 268 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  52.76 
 
 		 335 aa  332  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  66.03 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  51.64 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  61.03 
 
 		 295 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  64.91 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  50.66 
 
 		 324 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  49.36 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  50.26 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  61.03 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  51.04 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  50.52 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  50.52 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  50.52 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  51.34 
 
 		 377 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  57.81 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  61.99 
 
 		 624 aa  305  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  60 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  57.58 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  45.71 
 
 		 450 aa  275  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  49.49 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  43.08 
 
 		 283 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  42.69 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  43.08 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  43.19 
 
 		 256 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  42.69 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.69 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  43.08 
 
 		 283 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.8 
 
 		 256 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  43.19 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  42.8 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  39.93 
 
 		 285 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.21 
 
 		 283 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.09 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  44.62 
 
 		 293 aa  209  9e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  46.07 
 
 		 288 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  45.7 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 302 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.43 
 
 		 282 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.92 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.48 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.92 
 
 		 298 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.85 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  40.6 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  43.73 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.75 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  43.51 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  40.51 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  41.97 
 
 		 274 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  42.97 
 
 		 257 aa  196  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.08 
 
 		 278 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  42.65 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.08 
 
 		 278 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  41.98 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  40.74 
 
 		 314 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.84 
 
 		 286 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.84 
 
 		 286 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.15 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  39.44 
 
 		 280 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  40 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  42.75 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  42.75 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.07 
 
 		 269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.59 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  40.94 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.3 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  37.1 
 
 		 295 aa  189  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.18 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.73 
 
 		 294 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  36.54 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.34 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  42.01 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  43.63 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  41.98 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  38.06 
 
 		 310 aa  186  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  43.63 
 
 		 297 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  40.85 
 
 		 301 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.13 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  40.28 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  40.85 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>