More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13952 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  100 
 
 
344 aa  681    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  79.7 
 
 
330 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  79.7 
 
 
330 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  79.7 
 
 
330 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  76.4 
 
 
334 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  77.15 
 
 
331 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  66.05 
 
 
391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  65.72 
 
 
341 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  65.98 
 
 
328 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  63.8 
 
 
331 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  59.94 
 
 
329 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  58.38 
 
 
318 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  58.77 
 
 
335 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  54.9 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  58.21 
 
 
312 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  54.55 
 
 
333 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  60.85 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  57.36 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  54.64 
 
 
377 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  55.76 
 
 
321 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  55.06 
 
 
347 aa  309  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  54.63 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  57.14 
 
 
472 aa  306  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  59.42 
 
 
309 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  53.96 
 
 
324 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  61.03 
 
 
383 aa  299  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  59.44 
 
 
529 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  61.79 
 
 
410 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  53.37 
 
 
314 aa  292  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  48.94 
 
 
379 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  56.03 
 
 
367 aa  282  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  58.11 
 
 
268 aa  271  9e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  59.3 
 
 
438 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  58.16 
 
 
394 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  53.26 
 
 
398 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  46.1 
 
 
450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  47.32 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  55.36 
 
 
624 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  43.98 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.46 
 
 
286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.46 
 
 
286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  37.39 
 
 
302 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  41.54 
 
 
285 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  37.2 
 
 
310 aa  202  8e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.51 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  39.08 
 
 
282 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  37.8 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  37.31 
 
 
282 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  37.92 
 
 
294 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  37.18 
 
 
289 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.51 
 
 
279 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  40.77 
 
 
283 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.97 
 
 
283 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  38.15 
 
 
322 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.77 
 
 
283 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  40.77 
 
 
283 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  36.28 
 
 
286 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.77 
 
 
283 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  39.36 
 
 
284 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  41.11 
 
 
283 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  42.53 
 
 
256 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  41.18 
 
 
283 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.31 
 
 
294 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  39.38 
 
 
306 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  40.42 
 
 
283 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40.82 
 
 
305 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
298 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  37.61 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  39.69 
 
 
298 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.15 
 
 
256 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.13 
 
 
298 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.14 
 
 
283 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  38.46 
 
 
286 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  40.91 
 
 
310 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  38.84 
 
 
307 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  35.98 
 
 
303 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  43.51 
 
 
298 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 
284 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  39.88 
 
 
292 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.39 
 
 
304 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  43.51 
 
 
298 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  39.69 
 
 
293 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  41.18 
 
 
319 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  39.34 
 
 
305 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  36.09 
 
 
305 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  39.38 
 
 
293 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  39.38 
 
 
293 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  37.5 
 
 
284 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  52.76 
 
 
294 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  52.76 
 
 
294 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  35.76 
 
 
286 aa  186  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  40.28 
 
 
304 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  40.3 
 
 
296 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  38.99 
 
 
290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  38.43 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  38.99 
 
 
290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  38.43 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  39.76 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  34.98 
 
 
281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>