More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5407 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  100 
 
 		 377 aa  733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  56.3 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  58.58 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  55.77 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  56.28 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  55.26 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  56.28 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  56.28 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  56.06 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  52.52 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  65.91 
 
 		 335 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  65.53 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  52.24 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  54.91 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  52.88 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  64.5 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  58.76 
 
 		 318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  64.53 
 
 		 333 aa  311  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  61.65 
 
 		 529 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  59.78 
 
 		 295 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  63.64 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  50.68 
 
 		 323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  61.74 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  50.27 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  51.34 
 
 		 383 aa  296  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  58.76 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  62.35 
 
 		 268 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  49.14 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  60.22 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  48.39 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  59.93 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  56.38 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  49.87 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  43.94 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  50.76 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  55.94 
 
 		 624 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  45.2 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  47.94 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40 
 
 		 286 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  43.19 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  43.19 
 
 		 283 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  45.95 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  43.55 
 
 		 256 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.8 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  42.8 
 
 		 283 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.37 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.37 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  43.19 
 
 		 283 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  42.64 
 
 		 283 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  42.8 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.41 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  43.15 
 
 		 256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.96 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  45.16 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  42.41 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  44.53 
 
 		 293 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.7 
 
 		 285 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40.7 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.46 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  44.91 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  38.7 
 
 		 303 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  38.64 
 
 		 289 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  44.49 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  39.22 
 
 		 302 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  50 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  42.19 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  42.75 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  37.98 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  36.08 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  39.15 
 
 		 422 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.63 
 
 		 307 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  41.73 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  48.57 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  43.36 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  38.6 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.62 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  41.52 
 
 		 299 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  40.55 
 
 		 286 aa  184  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.1 
 
 		 279 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  38.78 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  43.6 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  43.6 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 310 aa  183  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  43.32 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  51.09 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.1 
 
 		 279 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  50.77 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  38.11 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.89 
 
 		 278 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.89 
 
 		 278 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  39.54 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  49.77 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  52.97 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  49.77 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  47.47 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.63 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>