More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0207 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  100 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  68.32 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  58.84 
 
 		 306 aa  351  8.999999999999999e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  58.55 
 
 		 307 aa  338  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  51.51 
 
 		 296 aa  292  4e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  50.84 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  47.51 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  47.25 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  45.03 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  46.62 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  44.11 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  43.71 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  44.41 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  43.92 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  43.54 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  44.63 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.86 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  39.74 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.16 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  39.73 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  44 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.8 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  39.61 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  40.6 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  40.73 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 284 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.45 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  39.53 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.12 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  38.68 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  39.73 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  40.07 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  38.44 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  36.82 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  37.09 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  41.67 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  36.82 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  36.82 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  39.2 
 
 		 282 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  36.82 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  38.38 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.53 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  36.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  36.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  36.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  40.6 
 
 		 279 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  36.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  36.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  36.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  36.61 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  36.61 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  39.54 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  36.88 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  39.93 
 
 		 288 aa  195  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  39.93 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  37.88 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.23 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  36.88 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  38.57 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  38.23 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  38.67 
 
 		 257 aa  193  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.88 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.54 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  37.63 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.54 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.72 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.72 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  37.73 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  37.73 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  38.62 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  37.73 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  39.46 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  39.15 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  39.15 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.43 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  38.57 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.88 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  38.23 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  36.59 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  36.86 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  39.06 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  38.91 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  39.16 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  37.62 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  36.91 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  38.38 
 
 		 286 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  39.02 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  38.13 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  37.29 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.01 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  36.95 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  38 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  40.39 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  36.25 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  38.29 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>