More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2139 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  100 
 
 
367 aa  727    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0356  parB-like partition protein  48.48 
 
 
301 aa  245  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.378212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0117  parB-like partition protein  63.51 
 
 
301 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  41.19 
 
 
322 aa  205  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  48.05 
 
 
295 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  49.4 
 
 
282 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  45.25 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  45.25 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  46.08 
 
 
286 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  48.15 
 
 
279 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  48.15 
 
 
279 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  49.08 
 
 
272 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  46.98 
 
 
289 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  51.35 
 
 
274 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  45.85 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  48.85 
 
 
284 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  43.78 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.73 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  43.78 
 
 
283 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  43.32 
 
 
283 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  42.29 
 
 
283 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  43.78 
 
 
283 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  43.78 
 
 
283 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  42.17 
 
 
295 aa  187  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  44.1 
 
 
302 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  44.69 
 
 
305 aa  186  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.29 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  47.44 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.33 
 
 
287 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  43.32 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  46.3 
 
 
278 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  50.23 
 
 
306 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  49.54 
 
 
288 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  40.4 
 
 
281 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  46.01 
 
 
285 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  46.79 
 
 
305 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  45.83 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  44.4 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  47.03 
 
 
310 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  47.42 
 
 
283 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  42.06 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  40.59 
 
 
303 aa  179  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  46.05 
 
 
304 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  43.89 
 
 
289 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  44 
 
 
294 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.44 
 
 
279 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  48.98 
 
 
309 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  45.05 
 
 
292 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  49.26 
 
 
529 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  42.34 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  43.44 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  46.46 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  43.9 
 
 
333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  45.83 
 
 
256 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  44.68 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.81 
 
 
282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  47.47 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  44.29 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  41.41 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  42.99 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  43.12 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  43.94 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  44 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  40.51 
 
 
305 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  46.81 
 
 
305 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  39.65 
 
 
278 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  40.16 
 
 
289 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.05 
 
 
290 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  44.28 
 
 
256 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  47.98 
 
 
331 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 
318 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  45.45 
 
 
288 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  43.89 
 
 
293 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.6 
 
 
290 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.16 
 
 
295 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.6 
 
 
290 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  47.69 
 
 
296 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  41.6 
 
 
296 aa  169  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  44.8 
 
 
284 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  43.93 
 
 
294 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  43.93 
 
 
294 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  39.57 
 
 
307 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  43.98 
 
 
283 aa  168  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  44.8 
 
 
295 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  48.53 
 
 
298 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  44.93 
 
 
301 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.04 
 
 
319 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  48.99 
 
 
298 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  48.48 
 
 
298 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  44.02 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  43.38 
 
 
305 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  43.38 
 
 
297 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  43.38 
 
 
297 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  43.38 
 
 
305 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  42.99 
 
 
293 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  42.73 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  42.73 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  42.73 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  42.73 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>