More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4390 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  100 
 
 		 336 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  35.64 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  39.57 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  38.59 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  41.56 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  37.75 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  40.56 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  33.33 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  37.41 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  41.72 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  38.93 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  41.14 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  33.76 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  40.4 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  36.77 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  34.04 
 
 		 368 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  38.78 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  40.25 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  37.93 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.56 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  38.31 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.83 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.83 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  38.55 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  42.07 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  41.72 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  38.27 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  43.57 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  39.49 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1670  parB-like partition protein  34.85 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.925128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.33 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  39.39 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  40.76 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  40.82 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  36.13 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  36.63 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  35.81 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  35.45 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  37.75 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  37.42 
 
 		 285 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  38.82 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  34.42 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  36.71 
 
 		 272 aa  99  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  35.66 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  36.6 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  32.99 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.32 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  30.51 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.97 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  37.58 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  42.38 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  40.67 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  35.57 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.16 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  32.99 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39.07 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  27.88 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  27.88 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  40.38 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.27 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  39.07 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  38.46 
 
 		 307 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  31.98 
 
 		 283 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  32.49 
 
 		 283 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  34.93 
 
 		 269 aa  96.3  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  38.71 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  31.66 
 
 		 283 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  37.95 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  31.98 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  36.26 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  31.98 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  32.34 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  37.66 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  40.4 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  31.98 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  39.07 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  35.54 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 280 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  34.5 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  39.74 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  34.5 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  41.79 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  36.13 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  39.35 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  38.22 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  40.88 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  34.05 
 
 		 298 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  36.55 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  38.69 
 
 		 306 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  40.51 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  37.24 
 
 		 285 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  38.06 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>