More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0037 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  100 
 
 		 350 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  60.12 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  60.12 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  59.81 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  55.14 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  41.43 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  37.95 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  32.02 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  36.72 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  34.87 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  36.71 
 
 		 294 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  32.85 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  36.48 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  31.51 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  27.03 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  31.1 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.95 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  33.75 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  33.52 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  35.03 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  33.93 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  29.09 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  33.75 
 
 		 293 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  33.33 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  31.22 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  29.51 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  34.38 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  32.64 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  30.26 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  32.48 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  33.53 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  27.45 
 
 		 668 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  33.76 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  34.25 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  34.81 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  32.37 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  34.21 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  30.68 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  31.31 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  32.08 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.69 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  33.77 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  28.41 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  32.9 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  31.61 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  32.74 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  34 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  31.28 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  38.89 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 296 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  35.1 
 
 		 295 aa  67  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  33.16 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  32.9 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  33.16 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.49 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  34.16 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  34.12 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  33.76 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  29.24 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  34.01 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  35.14 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  35.14 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  30.3 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  36.67 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  37.41 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  31.76 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  31.13 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  33.53 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  33.95 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  31.18 
 
 		 605 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  32.37 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  33.12 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.7 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  31.41 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  31.47 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  31.76 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  34.18 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  34.18 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  32.22 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  29.68 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  32.08 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  33.13 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  31.47 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>