More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4975 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  100 
 
 		 311 aa  613  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  58.52 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  39.57 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  40.8 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  44.24 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  41.91 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  36.18 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  43.08 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  31.92 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  38.51 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  42.54 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  42.54 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  38.93 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  27.55 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  34.87 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  42.54 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  42.54 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  38.22 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  37.06 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  43.18 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  38.99 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  38.06 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  41.22 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  35.22 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  38.41 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  42.11 
 
 		 529 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  40.88 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  43.51 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  43.51 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  40.74 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  43.51 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  43.51 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  43.51 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  35.81 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  39.69 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  38.36 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  43.51 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  34.9 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  28.48 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  39.58 
 
 		 358 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  44.26 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  28.48 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  41.22 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  32.12 
 
 		 283 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  36.18 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  42.75 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  40.44 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.75 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.75 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.75 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  41.98 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 294 aa  89.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  38.97 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  41.98 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.68 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  36.05 
 
 		 393 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  39.69 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  38.06 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  39.55 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  37.93 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  39.26 
 
 		 472 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  37.25 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  28.02 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  28.23 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  38.41 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  28.23 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  39.55 
 
 		 401 aa  86.3  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  38 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  34.56 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  36.36 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  34.38 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  34.38 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  40.15 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  37.96 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  36.36 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  37.84 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  37.88 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  37.59 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  35.86 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  32.93 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  30 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  40 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  38.35 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  30.92 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.57 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  35.11 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  30 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  37.67 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  41.09 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  37.02 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>