More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6444 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  100 
 
 		 349 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  100 
 
 		 349 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  85.27 
 
 		 355 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  65.91 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  58.03 
 
 		 350 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  38.46 
 
 		 378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  35.41 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  40 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  29.75 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  34.51 
 
 		 296 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  29.82 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  31.36 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  35.26 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  28.48 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  36.04 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.22 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  36.48 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  36.32 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  32.64 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  35.26 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  34.74 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  35.19 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  34.18 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  35.57 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  31.22 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  31.07 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  31.22 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  33.93 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  30.2 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.32 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  32.04 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  32.26 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  34.81 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  34.21 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  34.21 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.92 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  34.46 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  29.03 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  33.68 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  37.25 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  31.95 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  32.93 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  34.66 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  33.71 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  32.37 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  29.07 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  32.29 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  33.16 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  35.1 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  32.64 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  31.91 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  31.22 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  37.25 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  32.6 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.84 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.84 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  29.94 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  29.35 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  29.78 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  32.63 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  33.11 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31.46 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  32.63 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  33.16 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  29.65 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  31.45 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  32.63 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  32.5 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  35.19 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  32.53 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  35.15 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  32.48 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  30.81 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  29.9 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  33.76 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  30.81 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  28.98 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  32.93 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  32.93 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  32.91 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  28.92 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  32.22 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  34.44 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>