More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1670 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1670  parB-like partition protein  100 
 
 		 345 aa  702    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.925128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  38.55 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  33.19 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  31.91 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  39.13 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  39.31 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  34.39 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  33.98 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  32.75 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  34.33 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  32.85 
 
 		 279 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  29.49 
 
 		 289 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  36.36 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  34.01 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  31.11 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  40.25 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  32.22 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  34.63 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  32.51 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  31.51 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  36.57 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  31.56 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  31.56 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  32.88 
 
 		 282 aa  99.8  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  28 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  32.08 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.72 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  34.04 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.72 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  33 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  32 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  33.92 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  34.83 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  30.57 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  30.91 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  35.29 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  31.58 
 
 		 298 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  32.95 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  31.73 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  31.1 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.37 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  33.01 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  30.67 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  34.18 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  33.01 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  30.88 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  34.16 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  34.02 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  31.12 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  30.53 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  34.08 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  33.02 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  30.53 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  35.84 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  33.02 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  33.02 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  35.26 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  36.23 
 
 		 298 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.05 
 
 		 304 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  33.71 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  32.96 
 
 		 310 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  28.71 
 
 		 286 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  28.71 
 
 		 286 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  36.36 
 
 		 292 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  26.95 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  33.17 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  31.43 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  33.72 
 
 		 529 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  34.66 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  29.74 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  32.74 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  35.62 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  28.79 
 
 		 269 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  32.49 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  30.39 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  30.54 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  26.95 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  32.37 
 
 		 286 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  34.13 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 379 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  39.01 
 
 		 286 aa  90.5  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 288 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  34.07 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  34.5 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  32.61 
 
 		 261 aa  90.1  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  34.73 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  32.56 
 
 		 281 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  35.23 
 
 		 285 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  32.8 
 
 		 294 aa  89.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  34.32 
 
 		 295 aa  89.4  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  35 
 
 		 283 aa  89.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  33.95 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>