More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0015 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  100 
 
 		 340 aa  688    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  35.64 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  38.34 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  31.42 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  32.42 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  33.65 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  31.92 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  29.82 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  29.82 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  40.51 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  42.14 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.83 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  36.76 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  26.95 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  40.28 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  35.39 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  36.72 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  39.44 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  41.83 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  37.42 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  35.1 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  39.07 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  35.1 
 
 		 283 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  35.1 
 
 		 283 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  37.13 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  37.74 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  35.1 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.73 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  36.31 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  34.15 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  36 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  35.1 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  35.66 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  35.96 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  36.81 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  36.88 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  36.05 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  37.23 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  34.44 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  34.44 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  38.75 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  35.66 
 
 		 256 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  38.93 
 
 		 282 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  33.77 
 
 		 283 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  31.08 
 
 		 272 aa  99.8  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  43.65 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  40.77 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  33.18 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  36.26 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  42.34 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  42.34 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  42.03 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.13 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.15 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  37.42 
 
 		 296 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.87 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  36.23 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  38.04 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  38 
 
 		 303 aa  96.3  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  35.63 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  43.55 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.86 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  38.24 
 
 		 290 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  36.13 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 278 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  40.41 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 278 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.01 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  35.58 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  34.85 
 
 		 269 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  36.67 
 
 		 294 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  37.27 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  40.32 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  37.18 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  30.86 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  38.55 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  30.13 
 
 		 261 aa  95.1  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  34.32 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  35.62 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.51 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  34.44 
 
 		 286 aa  94  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  37.01 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  37.67 
 
 		 294 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  36.91 
 
 		 285 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  37.06 
 
 		 290 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  35.48 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>