More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6342 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  100 
 
 		 378 aa  760    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  44.08 
 
 		 320 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  32.77 
 
 		 349 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  32.77 
 
 		 349 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  29.89 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  37.68 
 
 		 355 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  39.7 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  34.42 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  32.18 
 
 		 306 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  33.77 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  33.52 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  37.33 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  36.13 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  36.81 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.21 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  30.32 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  33.15 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  30.81 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.77 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  36.02 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  35.67 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  34.48 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  30.81 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  34.62 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  35.12 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  34.68 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  33.33 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  34.52 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  31.93 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  30.32 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  31.36 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  29.07 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  32.38 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  32.77 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  35.03 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  33.77 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  35.37 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  30.52 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  31.33 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  31.31 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  30.39 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  34.73 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  33.99 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  33.99 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  33.99 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  35.66 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  31.69 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  33.54 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  35.19 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  32.05 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  34.69 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1719  parB family protein  36.88 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  33.16 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  30.46 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32.26 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31.61 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1670  parB-like partition protein  33.78 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.925128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31.61 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  33.76 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  36.13 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  33.97 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  30.2 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  32.75 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  35.06 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  33.33 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  31.64 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  30.9 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  31.37 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  32.69 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  33.55 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  34.3 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  29.88 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  32.9 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  31.68 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.29 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  32.05 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>