More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0783 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  100 
 
 		 320 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  44.08 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  41.43 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  32.48 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  33.02 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  33.02 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  30.79 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  43.48 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  44.24 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  41.21 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  38.65 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  42.76 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  47.97 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  36.14 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  39.74 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.99 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  41.22 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  44.44 
 
 		 368 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  37.04 
 
 		 272 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  34.38 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  42.65 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  42.65 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  42.65 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  42.65 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  35.37 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  35.76 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  37.75 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  42.65 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  42.65 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  42.65 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.91 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  40.91 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  43.33 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40.91 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  38.03 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  44.22 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  38.12 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  40.91 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.91 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  35.63 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  39.57 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  35.71 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  37.34 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  38.69 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.37 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  37.34 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  33.77 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  37.25 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  34.39 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.58 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  34.17 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  36.88 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  39.53 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  38.41 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  36.55 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  37.5 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  34.29 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  34.93 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  38.71 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  34.44 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  35.42 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  42.65 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  34.3 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  42.42 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  36.81 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  34.21 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  40.54 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  34.87 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  39.01 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32.89 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  32.13 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  37.91 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  35.97 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  43.7 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  40.44 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  40.46 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  36.36 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  32.8 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  32.18 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  38.78 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  40 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  30.88 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>