More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6062 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  100 
 
 		 369 aa  748    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  35.8 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  38.07 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  38.93 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  41.1 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  38.51 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  38.61 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  38.16 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  39.07 
 
 		 294 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  37.91 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  40.54 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  35.76 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  41.56 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  34.09 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  35.71 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  35.76 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  37.65 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  38.2 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.59 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  37.16 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  35.94 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  34.25 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  35.57 
 
 		 310 aa  98.6  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 298 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  38.41 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  40.54 
 
 		 290 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  37.25 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  37.68 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  39.16 
 
 		 268 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  36.92 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  36.99 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  36.99 
 
 		 313 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  35.12 
 
 		 293 aa  97.1  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  35.12 
 
 		 293 aa  97.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  35.71 
 
 		 306 aa  97.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  38.19 
 
 		 297 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  32.65 
 
 		 279 aa  96.7  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  35.14 
 
 		 302 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  31.65 
 
 		 294 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  35.42 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  38.13 
 
 		 296 aa  96.3  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 293 aa  96.3  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  34.87 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  39.49 
 
 		 298 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  39.47 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  37.75 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  41.61 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  36.49 
 
 		 268 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  41.84 
 
 		 286 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  37.91 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  35.5 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  37.34 
 
 		 290 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  37.34 
 
 		 290 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  33.95 
 
 		 290 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  38.73 
 
 		 298 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  38.73 
 
 		 298 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  36.62 
 
 		 287 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  36.69 
 
 		 296 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 295 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  35.06 
 
 		 288 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  36.54 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  37.67 
 
 		 305 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  35.42 
 
 		 281 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  32.75 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  37.65 
 
 		 290 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  40.41 
 
 		 294 aa  92.8  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  36.71 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  36.71 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  39.44 
 
 		 280 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  36.08 
 
 		 283 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  40.97 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  37.34 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  37.82 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  37.84 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 299 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  37.82 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  36.77 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  38.67 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  35.71 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  34.53 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  37.06 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  37.82 
 
 		 303 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  38.31 
 
 		 311 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  41.26 
 
 		 291 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  38.03 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.13 
 
 		 256 aa  90.5  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 286 aa  90.5  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>