More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0001 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  47.62 
 
 
283 aa  232  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  45.42 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  46.37 
 
 
283 aa  218  7e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  39.39 
 
 
319 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  43.67 
 
 
296 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  43.08 
 
 
296 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  42.17 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  43.36 
 
 
303 aa  198  6e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  43.32 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  43.32 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  42.68 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  42.29 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  42.21 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  39.77 
 
 
293 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  42.51 
 
 
293 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  41.39 
 
 
294 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  40.49 
 
 
293 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  40.48 
 
 
298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  41.3 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  38.91 
 
 
326 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  38.11 
 
 
315 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
298 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  37.97 
 
 
309 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  38.4 
 
 
290 aa  188  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  40.71 
 
 
296 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  41.08 
 
 
293 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  39.61 
 
 
292 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  41.53 
 
 
306 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  38.4 
 
 
288 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  39.61 
 
 
292 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  39.85 
 
 
307 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  41.15 
 
 
304 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  40.24 
 
 
286 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  39.61 
 
 
292 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  37.55 
 
 
280 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  39.61 
 
 
292 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  39.06 
 
 
292 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.64 
 
 
294 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.36 
 
 
290 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  39 
 
 
288 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  38.34 
 
 
298 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  40.46 
 
 
286 aa  185  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.16 
 
 
286 aa  185  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  40.16 
 
 
290 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  40.16 
 
 
290 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  39.36 
 
 
290 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  39.36 
 
 
290 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  42.17 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.15 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  37.65 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  37.11 
 
 
298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.04 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  37.25 
 
 
263 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  38.82 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  38.82 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  38.82 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  38.82 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.15 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  35.91 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  39.77 
 
 
292 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  39.36 
 
 
290 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  40.49 
 
 
294 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  40.08 
 
 
257 aa  181  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  39.36 
 
 
290 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  40.4 
 
 
294 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  39.08 
 
 
287 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.64 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  37.11 
 
 
299 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  39.26 
 
 
286 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  37.21 
 
 
295 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  37.9 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  39.36 
 
 
290 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.22 
 
 
289 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  39.61 
 
 
305 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  39.37 
 
 
281 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  37.6 
 
 
294 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  39.06 
 
 
306 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  38.91 
 
 
294 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  37.27 
 
 
288 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  38.4 
 
 
305 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  40 
 
 
304 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  38.19 
 
 
291 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  39.92 
 
 
284 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  37.21 
 
 
286 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  39.36 
 
 
290 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  39.2 
 
 
284 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  36.26 
 
 
298 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  41.35 
 
 
290 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  38.11 
 
 
306 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  38.19 
 
 
301 aa  175  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  40.16 
 
 
272 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  37.5 
 
 
294 aa  175  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  40.48 
 
 
296 aa  175  7e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  37.93 
 
 
303 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  35.52 
 
 
283 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  36.15 
 
 
298 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  36.64 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  38.19 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  40.33 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>