More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0006 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  100 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  85.66 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  85.66 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  48.58 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  47.52 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  47.75 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  45.67 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  45.67 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  45.17 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  45.33 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  45.33 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  45.33 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  45.33 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  45.33 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  45.33 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  44.98 
 
 		 290 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  43.36 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  49.09 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  43.25 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  41.09 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  43.92 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  41.43 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  41.16 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  38.77 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  47.18 
 
 		 362 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  45.71 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  47.74 
 
 		 300 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  46.63 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  48.11 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  44.02 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  47.57 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  50 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  43.75 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  46.37 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  43.15 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  42.68 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  37.07 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  45.77 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  40.81 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  45.83 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.02 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  42.99 
 
 		 294 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  44.04 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  44.21 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  44.21 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  43.59 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  42.49 
 
 		 283 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  43.28 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  44.97 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  45.21 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  44.61 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  44.44 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  41.89 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  42.78 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.71 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  39.83 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.71 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.71 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  37.17 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.71 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  40 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  41.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  37.67 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  40.89 
 
 		 303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  37.67 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  46.91 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39.53 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  38.4 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  40.42 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  46.23 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  43.23 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  40.37 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  42.01 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.82 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  35.93 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  35.93 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  43.48 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  46.97 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  48.35 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  45.16 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  47.16 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  41.81 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  48.74 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  43.23 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  38.94 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  46.81 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  39.63 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  43.65 
 
 		 422 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  39.33 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  37.45 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  40.57 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>