More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1727 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  100 
 
 
280 aa  548  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.26 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.48 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 
289 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  37.27 
 
 
279 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  39.93 
 
 
283 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.69 
 
 
294 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  39.93 
 
 
283 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.62 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  40.94 
 
 
297 aa  188  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.25 
 
 
279 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.49 
 
 
283 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 
283 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  41.45 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  40.36 
 
 
283 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  39.58 
 
 
283 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.36 
 
 
283 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.37 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.71 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  37.77 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  39.1 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  39.27 
 
 
285 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  37.55 
 
 
284 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  47.37 
 
 
287 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  43.6 
 
 
272 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  36.17 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  36.82 
 
 
282 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  35.05 
 
 
323 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.51 
 
 
256 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  42.51 
 
 
256 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.2 
 
 
269 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  43.83 
 
 
284 aa  175  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.79 
 
 
286 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.79 
 
 
286 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  37.54 
 
 
292 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.04 
 
 
297 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  35.4 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  37.88 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  35.4 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  37.88 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  40.96 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  35.82 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  34.48 
 
 
298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  45.95 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  43.35 
 
 
286 aa  172  5e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  42.8 
 
 
305 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  42.96 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.62 
 
 
296 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.62 
 
 
301 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  38.93 
 
 
293 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  36.39 
 
 
299 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  34.62 
 
 
300 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  36.33 
 
 
282 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  36.97 
 
 
284 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  41.99 
 
 
293 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  41.81 
 
 
293 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  41.36 
 
 
314 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  35.61 
 
 
283 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  35.86 
 
 
293 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  48.66 
 
 
268 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.93 
 
 
278 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.93 
 
 
278 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.15 
 
 
294 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.76 
 
 
321 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  42.48 
 
 
288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  39.81 
 
 
322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  33.11 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  35.49 
 
 
296 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  37.86 
 
 
294 aa  165  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0440  stage 0 sporulation protein J  39.61 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.216076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  33.09 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  38.54 
 
 
312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  41.86 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  40.52 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.21 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  38.26 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  40.99 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  35.21 
 
 
326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  44.44 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  38.04 
 
 
283 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  34.81 
 
 
296 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  40.54 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  43 
 
 
282 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  34.13 
 
 
296 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  35.74 
 
 
303 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  35.05 
 
 
293 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  39.38 
 
 
261 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  38.38 
 
 
302 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  46.6 
 
 
280 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  33.78 
 
 
294 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  39.35 
 
 
278 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  36.94 
 
 
295 aa  158  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  43.84 
 
 
278 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  42.57 
 
 
281 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  36.15 
 
 
294 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  35.52 
 
 
310 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  40.65 
 
 
281 aa  158  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  38.4 
 
 
299 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  37.5 
 
 
286 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>