More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3554 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  88.61 
 
 
281 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  70.24 
 
 
290 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  70.24 
 
 
290 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  69.9 
 
 
290 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  69.9 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  69.9 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  69.9 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  69.9 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  69.9 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  69.9 
 
 
290 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  69.55 
 
 
290 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  69.9 
 
 
290 aa  387  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  57.89 
 
 
294 aa  318  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  51.35 
 
 
268 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  48.23 
 
 
279 aa  239  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  47 
 
 
279 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  47 
 
 
279 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  49.24 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  41.72 
 
 
322 aa  232  6e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  46.74 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  47.29 
 
 
284 aa  225  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  42.23 
 
 
293 aa  222  7e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  42.8 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  42.48 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  39.86 
 
 
280 aa  208  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  49.34 
 
 
294 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  43.1 
 
 
286 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  41.79 
 
 
305 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  51.6 
 
 
289 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  44.84 
 
 
305 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  42.53 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  45.89 
 
 
289 aa  182  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.06 
 
 
295 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  43.61 
 
 
286 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  45.09 
 
 
288 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  47.57 
 
 
323 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  49.74 
 
 
298 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  43.84 
 
 
292 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  49.74 
 
 
298 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  47.64 
 
 
279 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  45.92 
 
 
302 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  41.55 
 
 
282 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  46.8 
 
 
279 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  43.36 
 
 
286 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  43.36 
 
 
286 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  45.45 
 
 
296 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.6 
 
 
287 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.2 
 
 
285 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  46.77 
 
 
298 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.19 
 
 
290 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  49.21 
 
 
298 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  44.39 
 
 
310 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  46.92 
 
 
279 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.33 
 
 
294 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  44.79 
 
 
282 aa  175  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  46.84 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  48.84 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  42.92 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  44.28 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.06 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  44.61 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  44.61 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.26 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.26 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  46.03 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  42.33 
 
 
529 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  46.03 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  43.65 
 
 
306 aa  172  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  44.66 
 
 
288 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  41.1 
 
 
304 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  42.65 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  44.5 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  45.45 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  48.73 
 
 
269 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  45.13 
 
 
289 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  44.9 
 
 
283 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  41.59 
 
 
335 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  44.97 
 
 
293 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  46.39 
 
 
305 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.22 
 
 
289 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  44.9 
 
 
401 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.45 
 
 
283 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  44.04 
 
 
283 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  46.07 
 
 
286 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  41.98 
 
 
283 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  42.78 
 
 
280 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  44.04 
 
 
283 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  45.73 
 
 
278 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  44.5 
 
 
326 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  169  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.86 
 
 
290 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  44.56 
 
 
283 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  44.56 
 
 
283 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  45.95 
 
 
274 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  43.68 
 
 
317 aa  168  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.72 
 
 
329 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  39.02 
 
 
294 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  39.02 
 
 
294 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  40.09 
 
 
283 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>