More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0014 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  100 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  44.2 
 
 
296 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  38.74 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  39.44 
 
 
282 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  43.65 
 
 
295 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  41.14 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  42.61 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  42.53 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  37.77 
 
 
297 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  46.39 
 
 
298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.78 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  38.7 
 
 
261 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1453  parB-like partition protein  37.5 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  42.41 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  44.17 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  45.95 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  44.79 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  44.79 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  45.4 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  47.18 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  41.11 
 
 
293 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  41.11 
 
 
293 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  44.79 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.85 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  44.17 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  39.9 
 
 
298 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  47.26 
 
 
306 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  39.9 
 
 
298 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  39.9 
 
 
298 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  33.2 
 
 
292 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  38.77 
 
 
294 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  44.9 
 
 
278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  44.9 
 
 
278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  48.3 
 
 
294 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  41.27 
 
 
283 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  47.95 
 
 
286 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  40 
 
 
281 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.42 
 
 
281 aa  124  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  44.17 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  44.17 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  45.39 
 
 
283 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  45.89 
 
 
401 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  45.45 
 
 
256 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  46.21 
 
 
282 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  45.45 
 
 
280 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  38.16 
 
 
358 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.98 
 
 
289 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  38.74 
 
 
289 aa  122  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  42.42 
 
 
293 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  46.1 
 
 
293 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  45.27 
 
 
256 aa  122  5e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  41.62 
 
 
294 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  42.58 
 
 
286 aa  122  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  45.39 
 
 
296 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  36.23 
 
 
375 aa  122  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  45.45 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  39.16 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  47.18 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  47.59 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  45.99 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  48.53 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  41.94 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  36.94 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  36.23 
 
 
371 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  45.7 
 
 
284 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  40.45 
 
 
314 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  38.59 
 
 
268 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  45.64 
 
 
268 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  42.31 
 
 
294 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  46.21 
 
 
295 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  38.78 
 
 
255 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
321 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  37.68 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  36.23 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.94 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.93 
 
 
304 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  43.75 
 
 
319 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  44.97 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  50.75 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  39.89 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  42.96 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  42.33 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.11 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  38.15 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.85 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.82 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  50.75 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  41.61 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  36.93 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  40.7 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  50.75 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  39.34 
 
 
290 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 
298 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  39.34 
 
 
290 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  39.34 
 
 
290 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  35.98 
 
 
310 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  40.98 
 
 
290 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  39.76 
 
 
295 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  39.34 
 
 
290 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  36.63 
 
 
323 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>