More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6163 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  100 
 
 
323 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  72.14 
 
 
324 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  52.96 
 
 
324 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  50.62 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  44.6 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  36.94 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  44.65 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  33.06 
 
 
280 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  39.86 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  39.86 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  39.69 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  46.36 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  38.24 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  39.89 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  37.34 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  41.43 
 
 
280 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  39.89 
 
 
301 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  44.76 
 
 
367 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  40.57 
 
 
296 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  34.4 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.51 
 
 
255 aa  112  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  36.31 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.86 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  39.44 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  40.4 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  41.67 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  38.25 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  42.28 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  39.13 
 
 
256 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.96 
 
 
323 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36.31 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.03 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  38.3 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.03 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.72 
 
 
289 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  41.5 
 
 
529 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  39.13 
 
 
256 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.3 
 
 
283 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.44 
 
 
295 aa  109  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  37.93 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  43.48 
 
 
286 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  36.14 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  39.6 
 
 
287 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  45.03 
 
 
341 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  39.2 
 
 
294 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  32 
 
 
303 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38.82 
 
 
302 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  42.03 
 
 
306 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  40.79 
 
 
311 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  39.01 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  42.48 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  40.85 
 
 
280 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  37.14 
 
 
289 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  44.05 
 
 
293 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  40.25 
 
 
294 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  39.39 
 
 
283 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  45.16 
 
 
293 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  36.91 
 
 
294 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  44.03 
 
 
294 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  41.38 
 
 
297 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  39.07 
 
 
305 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40.69 
 
 
274 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  39.57 
 
 
281 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  30.25 
 
 
298 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  34.88 
 
 
293 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  31.71 
 
 
286 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  31.71 
 
 
286 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  35.76 
 
 
285 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  36.05 
 
 
304 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.31 
 
 
310 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  39.6 
 
 
298 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.36 
 
 
304 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  43.54 
 
 
331 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  39.04 
 
 
290 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  38.75 
 
 
299 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  36.67 
 
 
284 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  33.18 
 
 
294 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  41.52 
 
 
331 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  39.44 
 
 
268 aa  103  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.72 
 
 
256 aa  103  4e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  38.16 
 
 
313 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 
293 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  38.96 
 
 
310 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.31 
 
 
272 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  38.16 
 
 
311 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  37.32 
 
 
289 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  37.74 
 
 
281 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.84 
 
 
281 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  38.6 
 
 
313 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.72 
 
 
288 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.98 
 
 
290 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.98 
 
 
290 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  37.13 
 
 
304 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  43.62 
 
 
319 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  42.76 
 
 
288 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  40.94 
 
 
303 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>