More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5559 on replicon NC_011730
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  100 
 
 
400 aa  792    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  57.5 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  46.97 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5493  parB-like partition protein  46.74 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  49.1 
 
 
293 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  50.98 
 
 
296 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  45.68 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  48.41 
 
 
303 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  53.27 
 
 
289 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  44.36 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  58.33 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  58.49 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.46 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  55.96 
 
 
274 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  53.27 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  51.4 
 
 
286 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  52.34 
 
 
305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  51.38 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  51.38 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  51.38 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  51.38 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  51.38 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  52.34 
 
 
305 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  51.38 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  51.38 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  52.34 
 
 
305 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  56.19 
 
 
295 aa  120  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  52.34 
 
 
297 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  52.34 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  52.34 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.97 
 
 
285 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  48.44 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  34.45 
 
 
280 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  50.39 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  50.46 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.36 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  53.61 
 
 
294 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  58.33 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  55.05 
 
 
272 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  51.85 
 
 
295 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  54.87 
 
 
286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  47.89 
 
 
304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  43.5 
 
 
304 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  46.15 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  45.14 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  50.44 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  50.44 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  46.62 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  46.04 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  44.19 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  46.62 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  50.47 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  50.47 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  44.19 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  48.67 
 
 
297 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  42.11 
 
 
293 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  50.88 
 
 
311 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40 
 
 
294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  50 
 
 
314 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  53.12 
 
 
283 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  46.34 
 
 
290 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  54.17 
 
 
281 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  52.34 
 
 
281 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  43.48 
 
 
261 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  57.73 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  52.08 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  53.92 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  52.08 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  48.72 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  54.17 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  48.6 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  48.7 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  47.2 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  45.93 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  48.7 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  57.3 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  54 
 
 
313 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  45.45 
 
 
295 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  58.33 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.07 
 
 
282 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  42.14 
 
 
305 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.64 
 
 
290 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.41 
 
 
290 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.64 
 
 
290 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  42.75 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  40 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  42.77 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  43.21 
 
 
268 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  47.79 
 
 
255 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  47.01 
 
 
288 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  54.64 
 
 
296 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  50 
 
 
293 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  56.18 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  54.64 
 
 
301 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  53.12 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  48.6 
 
 
302 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  47.37 
 
 
278 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  43.28 
 
 
315 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  46.28 
 
 
310 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>