More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_A0021 on replicon NC_007411
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  100 
 
 
320 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  46.2 
 
 
328 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5493  parB-like partition protein  45.54 
 
 
311 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  49.58 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  45.17 
 
 
312 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  42.35 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5423  parB-like partition protein  38.18 
 
 
324 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  49.16 
 
 
400 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  45.19 
 
 
303 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  43.46 
 
 
291 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  34.65 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  37.63 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.5 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.5 
 
 
297 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  37.27 
 
 
286 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.5 
 
 
297 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  32.4 
 
 
295 aa  126  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  32.13 
 
 
289 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  34 
 
 
305 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  34.77 
 
 
298 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  34.77 
 
 
298 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.46 
 
 
272 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  33.6 
 
 
295 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  33.6 
 
 
295 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  33.6 
 
 
295 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  33.6 
 
 
295 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  33.6 
 
 
295 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  33.6 
 
 
295 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  33.6 
 
 
295 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  36.32 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  33.2 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.65 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  31.73 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  32.08 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  31.83 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  36.07 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  43.7 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  43.7 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  34 
 
 
295 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  43.7 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  33.46 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  33.98 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  38.94 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.57 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  32.8 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  35.4 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  32.32 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  38.99 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  33.61 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  30.98 
 
 
279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  41.21 
 
 
272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.86 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  35.02 
 
 
292 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  33.88 
 
 
299 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  34.32 
 
 
296 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  33.19 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  34.6 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.86 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  29.37 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.64 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  32.05 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.89 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  31.69 
 
 
289 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.52 
 
 
305 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  36.95 
 
 
296 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  35.61 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  31.69 
 
 
301 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  33.2 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  33.2 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  36.36 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  33.18 
 
 
281 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  43.7 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  34.03 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  33.18 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  35.53 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  33.46 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  45.74 
 
 
313 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  33.2 
 
 
279 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  31.25 
 
 
279 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  31.08 
 
 
289 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  36.1 
 
 
288 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  31.25 
 
 
279 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  39.34 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  30.29 
 
 
283 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  34.62 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  35.48 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  35.96 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  33.2 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  31.75 
 
 
256 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  29.97 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  37 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  28.67 
 
 
283 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  29 
 
 
283 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  37.21 
 
 
317 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  28.8 
 
 
293 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  30.29 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  29.93 
 
 
303 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  34.76 
 
 
306 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  33.33 
 
 
305 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>